More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0612 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  100 
 
 		 152 aa  309  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  99.34 
 
 		 165 aa  307  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  82.24 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  70.34 
 
 		 160 aa  208  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  82.05 
 
 		 167 aa  206  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  69.35 
 
 		 136 aa  187  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  65.57 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  69.83 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  68.33 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  65.81 
 
 		 132 aa  176  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  64.75 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  63.56 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  64.17 
 
 		 138 aa  174  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  66.67 
 
 		 132 aa  173  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  65.79 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  59.38 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  62.1 
 
 		 130 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  65.49 
 
 		 144 aa  167  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  62.1 
 
 		 130 aa  167  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  64.04 
 
 		 132 aa  167  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  58.87 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  58.87 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  57.03 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  60.83 
 
 		 135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  60.83 
 
 		 135 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  60.83 
 
 		 135 aa  164  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  59.38 
 
 		 136 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  59.38 
 
 		 136 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  54.26 
 
 		 130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  59.5 
 
 		 129 aa  163  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  62.71 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  62.71 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  60.32 
 
 		 134 aa  163  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  62.71 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  57.26 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  57.26 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  57.94 
 
 		 135 aa  161  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  61.86 
 
 		 133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  59.02 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  59.13 
 
 		 117 aa  156  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  57.02 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  51.94 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 414 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 405 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  39.85 
 
 		 417 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 405 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  43.27 
 
 		 405 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  39.86 
 
 		 347 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 399 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 399 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 		 1003 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 2539 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  35.46 
 
 		 2476 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  35.46 
 
 		 2458 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 566 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 398 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 347 aa  97.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  37.6 
 
 		 412 aa  97.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 407 aa  97.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  38.79 
 
 		 2301 aa  97.4  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 2423 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  37.4 
 
 		 1989 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 1629 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 2009 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 388 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 2012 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  41.88 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  38.19 
 
 		 427 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  38.79 
 
 		 2284 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.11 
 
 		 337 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 1758 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 255 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 227 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.39 
 
 		 2336 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 1832 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 345 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2316  response regulator  38.46 
 
 		 527 aa  94  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000645629  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 227 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  35.71 
 
 		 1987 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  34.13 
 
 		 1992 aa  94  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 1647 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 423 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 423 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  37.19 
 
 		 235 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 421 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 394 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.71 
 
 		 1971 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  37.19 
 
 		 235 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 235 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 235 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 382 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  37.19 
 
 		 235 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 1646 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  37.19 
 
 		 235 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>