More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3634 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  88.8 
 
 		 135 aa  226  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  83.72 
 
 		 130 aa  225  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  88 
 
 		 135 aa  224  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  88 
 
 		 135 aa  224  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  83.2 
 
 		 136 aa  214  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  83.2 
 
 		 136 aa  214  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  82.4 
 
 		 135 aa  211  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  81.6 
 
 		 134 aa  209  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  75.81 
 
 		 161 aa  208  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  79.67 
 
 		 133 aa  206  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  80.49 
 
 		 137 aa  205  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  79.84 
 
 		 125 aa  204  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  74.42 
 
 		 129 aa  204  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  79.84 
 
 		 125 aa  203  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  78.69 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  78.69 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  82.61 
 
 		 117 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  76 
 
 		 132 aa  196  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  75 
 
 		 133 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  75 
 
 		 133 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  75 
 
 		 133 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  74.17 
 
 		 133 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  67.46 
 
 		 135 aa  190  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  69.11 
 
 		 133 aa  183  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  68.33 
 
 		 130 aa  182  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  68.29 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  69.42 
 
 		 136 aa  181  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  65.08 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  59.38 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  58.59 
 
 		 165 aa  167  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  57.69 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  61.48 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  62.07 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  63.48 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  63.16 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  62.61 
 
 		 136 aa  161  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  58.54 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  61.74 
 
 		 130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  61.74 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  59.13 
 
 		 160 aa  155  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  58.26 
 
 		 167 aa  153  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 414 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 405 aa  111  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 347 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 2539 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  40.52 
 
 		 2458 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  40.52 
 
 		 2476 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 347 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 2423 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 		 457 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 1646 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 1646 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 405 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 235 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 1647 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 412 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 381 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 405 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 246 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 427 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 345 aa  100  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 1629 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 455 aa  100  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  40.68 
 
 		 236 aa  99.4  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.28 
 
 		 1992 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 1431 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 1758 aa  99.4  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  37.5 
 
 		 1987 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 		 417 aa  98.6  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 243 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  38.33 
 
 		 1834 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 1832 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 233 aa  97.8  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 1974 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 247 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 231 aa  97.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 239 aa  97.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1874  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 320 aa  97.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.420153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  38.33 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 382 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.21 
 
 		 337 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 235 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.02 
 
 		 1866 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 421 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 234 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>