More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0058 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
347 aa  721    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  57.87 
 
 
347 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  46.98 
 
 
381 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  46.69 
 
 
345 aa  329  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  50 
 
 
414 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  47.73 
 
 
427 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  52.17 
 
 
457 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  54.35 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  50.76 
 
 
455 aa  146  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  27.2 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  29.74 
 
 
405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  31.18 
 
 
405 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
382 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
421 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  46.55 
 
 
398 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  45.69 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  45.69 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  40.31 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  40.6 
 
 
143 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  23.81 
 
 
412 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 
131 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
161 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
130 aa  106  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 
394 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
388 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
133 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  39.66 
 
 
135 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  35.48 
 
 
423 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
133 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  37.31 
 
 
145 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 
130 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  30.36 
 
 
423 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
384 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  39.66 
 
 
135 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
135 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  39.86 
 
 
165 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  39.86 
 
 
152 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
133 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
133 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  36.55 
 
 
391 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  39.66 
 
 
135 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  40 
 
 
141 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 
134 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
138 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
132 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  36.55 
 
 
391 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
137 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  39.13 
 
 
132 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  37.93 
 
 
136 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  37.93 
 
 
136 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  42.2 
 
 
135 aa  99.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  36.23 
 
 
160 aa  99.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
133 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  38.05 
 
 
117 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  40 
 
 
133 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4606  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
408 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  40.18 
 
 
132 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  37.72 
 
 
136 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  37.96 
 
 
179 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  41.96 
 
 
136 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  40.18 
 
 
147 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
144 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
130 aa  96.7  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
130 aa  96.7  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
138 aa  96.3  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
138 aa  96.3  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
132 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 
132 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  36.52 
 
 
129 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  35.65 
 
 
125 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
123 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 
125 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
2539 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 
167 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  38.39 
 
 
2476 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  38.39 
 
 
2458 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
2423 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  36.36 
 
 
2284 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  38.05 
 
 
2301 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
1758 aa  87  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
1974 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  31.61 
 
 
272 aa  86.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
1629 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
1647 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
1646 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
1832 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
1646 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 
226 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.64 
 
 
1971 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  36.61 
 
 
1834 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
1609 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
2212 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
1725 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
397 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.91 
 
 
236 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  35.65 
 
 
166 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>