More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01602 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  100 
 
 		 117 aa  241  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  97.44 
 
 		 133 aa  236  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  93.97 
 
 		 138 aa  227  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  93.97 
 
 		 138 aa  227  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  86.09 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  83.48 
 
 		 136 aa  206  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  83.48 
 
 		 136 aa  206  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  83.48 
 
 		 130 aa  204  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  82.61 
 
 		 135 aa  203  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  82.61 
 
 		 135 aa  203  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  82.61 
 
 		 135 aa  203  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  81.74 
 
 		 161 aa  203  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  83.48 
 
 		 135 aa  201  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  80.87 
 
 		 134 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  82.61 
 
 		 131 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  78.95 
 
 		 125 aa  191  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  74.78 
 
 		 133 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  78.95 
 
 		 125 aa  191  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  76.72 
 
 		 132 aa  191  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  74.78 
 
 		 133 aa  190  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  74.78 
 
 		 133 aa  190  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  73.91 
 
 		 133 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  73.5 
 
 		 129 aa  187  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  71.93 
 
 		 135 aa  187  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  68.38 
 
 		 130 aa  180  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  71.93 
 
 		 136 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  69.57 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  71.05 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  68.97 
 
 		 145 aa  173  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  64.1 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  64.1 
 
 		 130 aa  167  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  68.42 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  64.1 
 
 		 130 aa  166  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  64.04 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  64.91 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  64.04 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  64.04 
 
 		 132 aa  163  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  62.83 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  63.39 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  59.13 
 
 		 165 aa  156  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  59.13 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  61.95 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  60.18 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  57.39 
 
 		 179 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 414 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 2539 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 382 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 347 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 405 aa  103  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 246 aa  103  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  39.2 
 
 		 412 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  42.2 
 
 		 457 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 1758 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 2423 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  40 
 
 		 2458 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  40 
 
 		 2476 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  38.46 
 
 		 1888 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  38.46 
 
 		 2070 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  40.17 
 
 		 1834 aa  99.4  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  38.05 
 
 		 347 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 2137 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  37.72 
 
 		 417 aa  98.6  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 427 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 235 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.61 
 
 		 1992 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 1646 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  37.84 
 
 		 1987 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 1832 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 1646 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 1629 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 405 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  38.61 
 
 		 405 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 2022 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 1647 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 421 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  41.18 
 
 		 1866 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  38.94 
 
 		 381 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 2164 aa  94  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 398 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 233 aa  93.6  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.84 
 
 		 2336 aa  93.6  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  36.84 
 
 		 2026 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 225 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 236 aa  92.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  39.47 
 
 		 2092 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  36.52 
 
 		 1983 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 365 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 2026 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 1974 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.26 
 
 		 337 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  36.84 
 
 		 1970 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 455 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 398 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 2414 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>