More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3354 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  100 
 
 		 147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  92.25 
 
 		 132 aa  249  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  88 
 
 		 132 aa  232  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  87.9 
 
 		 132 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  88.98 
 
 		 132 aa  226  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  83.61 
 
 		 136 aa  224  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  84.3 
 
 		 130 aa  223  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  83.47 
 
 		 130 aa  221  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  86.44 
 
 		 144 aa  221  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  72.26 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  84.21 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  63.43 
 
 		 160 aa  192  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  71.43 
 
 		 136 aa  191  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  72.03 
 
 		 133 aa  189  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  70.94 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  70.09 
 
 		 138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  64.35 
 
 		 167 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  63.56 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  63.56 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  64.96 
 
 		 130 aa  170  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  61.48 
 
 		 129 aa  169  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  62.71 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  62.1 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  55.4 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  63.79 
 
 		 125 aa  166  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  63.79 
 
 		 125 aa  166  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  65.52 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  61.21 
 
 		 133 aa  164  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  61.21 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  62.18 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  62.18 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  61.21 
 
 		 133 aa  164  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  58.4 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  61.21 
 
 		 133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  62.07 
 
 		 161 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  61.34 
 
 		 136 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  61.34 
 
 		 136 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  61.34 
 
 		 134 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  61.02 
 
 		 138 aa  163  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  61.02 
 
 		 138 aa  163  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  62.07 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  62.83 
 
 		 117 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  61.34 
 
 		 135 aa  160  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  46.23 
 
 		 405 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  47.12 
 
 		 405 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 414 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  40.34 
 
 		 2301 aa  105  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 421 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 1646 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 1646 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 405 aa  104  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 1758 aa  103  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 1647 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  39.5 
 
 		 2284 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 382 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 246 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  39.34 
 
 		 412 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 427 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 2539 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  35.65 
 
 		 2458 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  35.65 
 
 		 2476 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 235 aa  98.6  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 1629 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 347 aa  98.2  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  36.96 
 
 		 417 aa  97.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.46 
 
 		 1956 aa  97.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  40.18 
 
 		 347 aa  97.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 2423 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  37.07 
 
 		 231 aa  97.8  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  38.46 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.96 
 
 		 1992 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.94 
 
 		 1971 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 123 aa  95.9  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  38.46 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  34.31 
 
 		 1989 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  37.07 
 
 		 231 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  35.09 
 
 		 1987 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  38.94 
 
 		 457 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 232 aa  95.5  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 255 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 455 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.94 
 
 		 337 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 226 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 231 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 566 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  42.59 
 
 		 248 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 223 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.48 
 
 		 234 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 121 aa  94  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  42.59 
 
 		 248 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  42.59 
 
 		 248 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>