More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1061 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  100 
 
 		 427 aa  878    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  48.22 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  45.43 
 
 		 414 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  41.09 
 
 		 457 aa  346  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  39.65 
 
 		 455 aa  331  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  31.18 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4606  response regulator receiver protein  29.76 
 
 		 408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  47.73 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  29.49 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  57.63 
 
 		 347 aa  157  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  26.98 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  27.51 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 384 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 405 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 421 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  31.08 
 
 		 423 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 423 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  40.83 
 
 		 132 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 161 aa  104  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 130 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 143 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 147 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 133 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 131 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 137 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 135 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3748  response regulator receiver protein  24.75 
 
 		 393 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 144 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  38.21 
 
 		 132 aa  98.6  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 136 aa  97.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 138 aa  97.4  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  38.94 
 
 		 117 aa  97.8  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 138 aa  97.4  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  36.6 
 
 		 165 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 138 aa  97.1  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  38.6 
 
 		 135 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  38.6 
 
 		 135 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 130 aa  96.7  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 135 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  38.94 
 
 		 160 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 		 132 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  38.19 
 
 		 152 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 130 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 130 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  36.84 
 
 		 136 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  36.84 
 
 		 136 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  34.19 
 
 		 125 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 132 aa  94.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 123 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 		 134 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  34.19 
 
 		 125 aa  94.4  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 132 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 133 aa  94.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  37.72 
 
 		 135 aa  94  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 133 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 133 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  40.17 
 
 		 179 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 133 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  38.94 
 
 		 167 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  38.05 
 
 		 141 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  37.93 
 
 		 136 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 129 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 145 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 133 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  38.39 
 
 		 2301 aa  87  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 2539 aa  87  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.4 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 1907 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.52 
 
 		 1866 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  31.13 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  35.04 
 
 		 2458 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  36.61 
 
 		 619 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  35.04 
 
 		 2476 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 1974 aa  83.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.19 
 
 		 1971 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 566 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1646 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  34.75 
 
 		 2284 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1646 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 123 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 234 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 1629 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 2423 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 1609 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1647 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>