More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3748 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3748  response regulator receiver protein  100 
 
 		 393 aa  777    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  35.37 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  36.9 
 
 		 405 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  36.9 
 
 		 405 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  34.24 
 
 		 412 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  23.61 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  23.65 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  24.19 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  24.19 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  24.75 
 
 		 427 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  24.26 
 
 		 398 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  22.81 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  22.16 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  22.74 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  22.74 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  23.79 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  23.06 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  24.32 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3316  response regulator receiver protein  22.08 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2801  response regulator receiver protein  22.08 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0414738  normal  0.24206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  24.86 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  23.39 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  39.6 
 
 		 143 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  20.82 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  34.74 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  21.89 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0988  response regulator receiver protein  24.59 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.331078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  33.67 
 
 		 132 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  21.78 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 130 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  21.78 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  32.32 
 
 		 123 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.62 
 
 		 593 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.62 
 
 		 593 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  30.61 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  30.61 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  31.31 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  30.82 
 
 		 1133 aa  63.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  32.59 
 
 		 1130 aa  63.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  29.59 
 
 		 136 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 135 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  29.59 
 
 		 136 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  29.59 
 
 		 137 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 		 134 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 132 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  30.61 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  31.19 
 
 		 119 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  27.55 
 
 		 136 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  35.96 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 		 1390 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  29.13 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  29.7 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  27.55 
 
 		 144 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  28.42 
 
 		 133 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  28.42 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  28.42 
 
 		 133 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  31.9 
 
 		 718 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 714 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 713 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  30.15 
 
 		 1111 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1798  response regulator receiver protein  28.28 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0425033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1528  adenylate/guanylate cyclase  27.83 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1128 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  28.71 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 1609 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  30 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  28.87 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 735 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  25.96 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 1390 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  25.96 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 119 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 1390 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  31.9 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  27.72 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  26.32 
 
 		 132 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 133 aa  57  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  27.55 
 
 		 130 aa  57  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  27.55 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 1385 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  27.37 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  26.47 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  26.8 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  25.51 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  28.76 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.61 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  27.73 
 
 		 1888 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>