More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1528 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1528  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 593 aa  1214    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 		 474 aa  153  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  25.47 
 
 		 1207 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  28.66 
 
 		 355 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  27.86 
 
 		 461 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  27.84 
 
 		 380 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  25.32 
 
 		 1156 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  27.24 
 
 		 561 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  25.58 
 
 		 1172 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  25.29 
 
 		 1180 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  28.24 
 
 		 461 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  27.48 
 
 		 456 aa  104  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 796 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  27.08 
 
 		 348 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  25.83 
 
 		 1133 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 265 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 1098 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  26.2 
 
 		 1130 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4646  two component transcriptional regulator  37.6 
 
 		 229 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 977 aa  100  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0123  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 223 aa  100  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 826 aa  100  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 1098 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  29.84 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  28.3 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  28.36 
 
 		 1179 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1433 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  28.78 
 
 		 466 aa  98.2  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.31 
 
 		 716 aa  98.2  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  27.84 
 
 		 1119 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2911  two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 228 aa  98.2  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  24.36 
 
 		 351 aa  97.8  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  26.85 
 
 		 265 aa  97.4  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  28.4 
 
 		 457 aa  97.1  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 		 847 aa  96.3  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 1548 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  28.79 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  27.33 
 
 		 348 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 266 aa  96.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2262  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.96 
 
 		 853 aa  95.1  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 224 aa  95.5  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 123 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1055 aa  95.1  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 1193 aa  94.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.44 
 
 		 469 aa  94.7  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  27.92 
 
 		 457 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.34 
 
 		 928 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4564  DNA-binding response regulator  36.59 
 
 		 229 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 390 aa  94  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 363 aa  94  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4969  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 229 aa  94  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4707  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 229 aa  93.6  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 		 755 aa  93.6  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4937  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 229 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5068  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 229 aa  93.6  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4932  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 229 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 229 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4546  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 229 aa  93.6  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.41 
 
 		 227 aa  93.6  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 704 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  27.55 
 
 		 457 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 224 aa  92.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.4 
 
 		 227 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 254 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 225 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 224 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4952  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 229 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  40.65 
 
 		 254 aa  92  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  36.88 
 
 		 1374 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 1341 aa  91.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.12 
 
 		 454 aa  92  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 		 665 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  29.68 
 
 		 421 aa  92  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  36.69 
 
 		 230 aa  92  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 225 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 265 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 225 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 225 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.52 
 
 		 225 aa  91.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  34.19 
 
 		 225 aa  91.3  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  34.19 
 
 		 225 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 225 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  27.34 
 
 		 1014 aa  91.3  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 1054 aa  91.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 225 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 225 aa  91.3  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  38.64 
 
 		 227 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 265 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 223 aa  91.3  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 		 876 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 225 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 265 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 225 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 225 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 254 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 		 1352 aa  91.3  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 265 aa  91.3  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 219 aa  91.3  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 		 929 aa  90.9  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 228 aa  90.9  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>