More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2781 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  100 
 
 
399 aa  818    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  100 
 
 
399 aa  818    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  75.44 
 
 
398 aa  610  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  44.68 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2801  response regulator receiver protein  39.85 
 
 
417 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0414738  normal  0.24206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3316  response regulator receiver protein  39.85 
 
 
417 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  44.26 
 
 
384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0988  response regulator receiver protein  34.9 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.331078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  34.92 
 
 
396 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  34.92 
 
 
396 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  34.85 
 
 
398 aa  237  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  33.59 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  28.61 
 
 
405 aa  182  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 
412 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  31.4 
 
 
405 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  31.86 
 
 
405 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  31.66 
 
 
414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  32.65 
 
 
423 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  28.12 
 
 
421 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  29.92 
 
 
427 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
423 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  28.54 
 
 
417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  26.97 
 
 
455 aa  152  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  26.62 
 
 
457 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  28.07 
 
 
382 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  27.76 
 
 
347 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  53.4 
 
 
123 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  40.88 
 
 
143 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  45.69 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
345 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  23.91 
 
 
391 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  23.6 
 
 
391 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3748  response regulator receiver protein  24.26 
 
 
393 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  38.73 
 
 
165 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  38.73 
 
 
152 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 
381 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
133 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
133 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
133 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 
130 aa  96.7  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
133 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  36.57 
 
 
179 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  34.4 
 
 
137 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 
134 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4606  response regulator receiver protein  24.42 
 
 
408 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  33.08 
 
 
136 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  33.08 
 
 
136 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  32.85 
 
 
1111 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  32 
 
 
135 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  38.53 
 
 
160 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  32 
 
 
135 aa  90.5  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 
167 aa  90.5  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  32.2 
 
 
132 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  34.15 
 
 
161 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  36.13 
 
 
1128 aa  89.4  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  34.82 
 
 
141 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  33.63 
 
 
117 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  31.3 
 
 
135 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  31.5 
 
 
133 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  32 
 
 
135 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  31.45 
 
 
125 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  35.65 
 
 
136 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  34.15 
 
 
129 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  31.4 
 
 
131 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  36.29 
 
 
1127 aa  87.8  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 
1177 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  32.79 
 
 
138 aa  86.7  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  32.79 
 
 
138 aa  86.7  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  30.77 
 
 
132 aa  86.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  29.84 
 
 
125 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
130 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  32.2 
 
 
132 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  31.9 
 
 
130 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  30.83 
 
 
136 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  32.11 
 
 
144 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
130 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  32.5 
 
 
133 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  32.2 
 
 
138 aa  84  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  31.15 
 
 
132 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  31.62 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  32.48 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  31.67 
 
 
135 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1956  response regulator receiver protein  29.74 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.942882 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.51 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.79 
 
 
941 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  28.06 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
566 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
204 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
503 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  32.76 
 
 
734 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
383 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  34.75 
 
 
1133 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  35.59 
 
 
1130 aa  77  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1352  response regulator receiver protein  29.79 
 
 
410 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  30.08 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1032  response regulator  35.34 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0894814  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  35.9 
 
 
1207 aa  76.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.09 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>