63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0988 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0988  response regulator receiver protein  100 
 
 		 417 aa  855    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.331078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2801  response regulator receiver protein  33.17 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0414738  normal  0.24206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3316  response regulator receiver protein  33.17 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  34.2 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  34.2 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  27.34 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  24.78 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  24.78 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  26.59 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  24.52 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  23.86 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  23.86 
 
 		 423 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  26.71 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  26.1 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  24.07 
 
 		 405 aa  87  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  24.66 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  25.07 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  19.76 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3748  response regulator receiver protein  24.59 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1352  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  27.19 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1509  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 137 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 		 641 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  24.78 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 255 aa  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  25.56 
 
 		 227 aa  49.7  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.27 
 
 		 1499 aa  49.7  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  24.43 
 
 		 143 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  27.06 
 
 		 131 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  24.48 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.17 
 
 		 764 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  22.73 
 
 		 261 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  26.14 
 
 		 123 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  21.19 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 392 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  23.39 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 245 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0013  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.53 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.992585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.61 
 
 		 664 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 		 1426 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  24.71 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  23.24 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  21.98 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  26.51 
 
 		 126 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 		 1356 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.18 
 
 		 223 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 126 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.18 
 
 		 223 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.18 
 
 		 1261 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.92 
 
 		 227 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  24.66 
 
 		 551 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.69 
 
 		 500 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  22.22 
 
 		 226 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2975  response regulator receiver protein  29.49 
 
 		 120 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 503 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0183  response regulator receiver protein  25.64 
 
 		 385 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.73 
 
 		 1651 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  20.43 
 
 		 356 aa  43.1  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.24 
 
 		 633 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>