More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1219 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  100 
 
 
126 aa  255  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.12 
 
 
397 aa  124  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 
392 aa  123  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 
391 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 
391 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.33 
 
 
602 aa  114  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  45.6 
 
 
404 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  51.92 
 
 
122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  52.34 
 
 
124 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  50.96 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  44.17 
 
 
124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  51.92 
 
 
125 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  43.22 
 
 
121 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 
121 aa  104  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  45.37 
 
 
123 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  44.07 
 
 
126 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  43.59 
 
 
144 aa  103  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
126 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
125 aa  103  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  44.83 
 
 
126 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.61 
 
 
530 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
126 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  45.37 
 
 
126 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  42.28 
 
 
1361 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  48.08 
 
 
120 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  45.37 
 
 
126 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  40.95 
 
 
125 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  41.8 
 
 
125 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  42.74 
 
 
123 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  43.97 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 
1362 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  42.74 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 
869 aa  98.2  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 
643 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  43.1 
 
 
121 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  41.67 
 
 
134 aa  97.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  41.67 
 
 
123 aa  97.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  43.27 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  43.81 
 
 
123 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
123 aa  96.7  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  43.81 
 
 
123 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
1274 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  41.88 
 
 
685 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  42.24 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  42.59 
 
 
126 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  44.76 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  44.76 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.65 
 
 
645 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 
643 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
643 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
964 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
643 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  44.76 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
1977 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.34 
 
 
657 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  45.19 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 
1007 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  40 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  39.32 
 
 
1060 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 
618 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  43.65 
 
 
935 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  42.24 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  41.38 
 
 
121 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  39.66 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
935 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
948 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  40.52 
 
 
1686 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  41.9 
 
 
121 aa  92  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
827 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1215  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  45.37 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
633 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
1681 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  41.74 
 
 
786 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
1245 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
784 aa  90.5  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 
1588 aa  90.5  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
1681 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  39.02 
 
 
641 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  41.74 
 
 
779 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
1352 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1478 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
1287 aa  89.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5565  response regulator receiver protein  43.64 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  41.32 
 
 
779 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1245 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3150  response regulator receiver protein  39.09 
 
 
152 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.82 
 
 
763 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>