More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4019 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  100 
 
 
396 aa  825    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  100 
 
 
396 aa  825    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  34.05 
 
 
394 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  33.59 
 
 
384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  34.92 
 
 
399 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  34.92 
 
 
399 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  34.72 
 
 
398 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  32.61 
 
 
398 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3316  response regulator receiver protein  31.73 
 
 
417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2801  response regulator receiver protein  31.73 
 
 
417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0414738  normal  0.24206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  31 
 
 
388 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  27.51 
 
 
421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0988  response regulator receiver protein  24.78 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.331078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  28.1 
 
 
423 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  24.46 
 
 
412 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  27.87 
 
 
423 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  23.01 
 
 
405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  39.72 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  39.72 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  23.39 
 
 
405 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  23.5 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  32.16 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  32.38 
 
 
427 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  24.57 
 
 
417 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  33.09 
 
 
143 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  39.29 
 
 
132 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  24.12 
 
 
414 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  39.29 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  40.18 
 
 
457 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
133 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
133 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  37.07 
 
 
619 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
347 aa  96.3  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  34.75 
 
 
133 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  34.75 
 
 
133 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  34.82 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  34.75 
 
 
133 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  38.74 
 
 
160 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 
167 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3748  response regulator receiver protein  22.74 
 
 
393 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  42 
 
 
123 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  30.22 
 
 
147 aa  93.2  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
455 aa  92.8  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  33.77 
 
 
165 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  35.82 
 
 
152 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  34.51 
 
 
138 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 
132 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  33.04 
 
 
120 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
2423 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  34.82 
 
 
134 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  32.56 
 
 
2458 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  32.74 
 
 
161 aa  90.1  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  35.04 
 
 
2476 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  33.63 
 
 
135 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  33.63 
 
 
135 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
944 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  33.63 
 
 
141 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  35.59 
 
 
121 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
132 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
132 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  33.63 
 
 
135 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  33.33 
 
 
136 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  33.33 
 
 
136 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  30.51 
 
 
130 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  32.46 
 
 
135 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  32.74 
 
 
137 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  32.14 
 
 
125 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  33.93 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  31.3 
 
 
136 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  32.14 
 
 
125 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  32.74 
 
 
130 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  31.86 
 
 
131 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  34.56 
 
 
179 aa  86.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
928 aa  86.3  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  33.91 
 
 
121 aa  86.3  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1974 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  32.46 
 
 
133 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  31.03 
 
 
136 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
130 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  29.69 
 
 
132 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  33.33 
 
 
117 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  29.2 
 
 
135 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
1907 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 
229 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  29.2 
 
 
129 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  32.14 
 
 
145 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.11 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  38.68 
 
 
146 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
130 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
566 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
120 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  31.25 
 
 
144 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
846 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  33.91 
 
 
121 aa  84  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  35.65 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.09 
 
 
869 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>