More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4868 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  58.54 
 
 		 382 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  41.91 
 
 		 423 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  41.91 
 
 		 423 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 405 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 391 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 405 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 421 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  40.6 
 
 		 347 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 405 aa  111  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 347 aa  110  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 398 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  43.31 
 
 		 394 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 414 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 388 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 384 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 396 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 396 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 		 457 aa  104  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 398 aa  103  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 455 aa  103  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 427 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  38.24 
 
 		 417 aa  100  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 123 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  40.18 
 
 		 381 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  36.22 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 255 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 2137 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 132 aa  93.6  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  35.88 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  36.44 
 
 		 2458 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  35.48 
 
 		 412 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  36.44 
 
 		 2476 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 133 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 345 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 231 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  36.44 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 1832 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  33.33 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  39.32 
 
 		 1888 aa  90.9  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  36.36 
 
 		 2026 aa  90.1  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 2026 aa  90.1  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 230 aa  89.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 236 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 2539 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 242 aa  89.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 236 aa  88.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 145 aa  88.6  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  37.01 
 
 		 1983 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  40.8 
 
 		 248 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  34.21 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 2423 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 243 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 242 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  34.86 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 243 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 259 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 1974 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 236 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 243 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 2022 aa  88.6  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  37.01 
 
 		 242 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  33.05 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  33.05 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  38.52 
 
 		 705 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 390 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  35.14 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 248 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 247 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 244 aa  88.6  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  40.16 
 
 		 248 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  41.6 
 
 		 248 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 248 aa  87.8  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 229 aa  87.8  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>