More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2999 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  100 
 
 		 421 aa  872    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  51.73 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  50.84 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  50.6 
 
 		 405 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  43.87 
 
 		 412 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3748  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 393 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  28.53 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  28.53 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  32.29 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  28.25 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  29.16 
 
 		 394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  27.51 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  27.51 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  27.98 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 384 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  27.3 
 
 		 417 aa  132  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  26.68 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  46.96 
 
 		 347 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  27.55 
 
 		 347 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 143 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3316  response regulator receiver protein  24.41 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2801  response regulator receiver protein  24.41 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0414738  normal  0.24206 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  37.31 
 
 		 141 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  24.51 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 132 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 147 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  38.52 
 
 		 132 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 132 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  37.19 
 
 		 132 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 136 aa  104  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  43.27 
 
 		 123 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  40.37 
 
 		 160 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 161 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  37.7 
 
 		 135 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 144 aa  100  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  41.28 
 
 		 135 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 135 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 130 aa  100  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 145 aa  99.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 130 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 137 aa  99.8  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  36.89 
 
 		 135 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 130 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  40.37 
 
 		 132 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4606  response regulator receiver protein  24.93 
 
 		 408 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 345 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 		 131 aa  96.7  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 135 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 133 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 133 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  38.53 
 
 		 167 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 133 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 133 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 134 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  38.39 
 
 		 117 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  38.53 
 
 		 136 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 138 aa  94.4  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 138 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 138 aa  94.4  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 129 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  35.65 
 
 		 125 aa  93.6  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  35.9 
 
 		 136 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  35.9 
 
 		 136 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 165 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 130 aa  93.2  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 232 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 152 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 125 aa  92  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 2137 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 246 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.37 
 
 		 465 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 225 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0791  response regulator receiver domain-containing protein  36.61 
 
 		 125 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778943 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 230 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 1559 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 133 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 246 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  39.45 
 
 		 230 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  38.53 
 
 		 256 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 1609 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  43.27 
 
 		 228 aa  88.2  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 		 229 aa  87.8  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  34.86 
 
 		 179 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 245 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 230 aa  86.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  37.07 
 
 		 234 aa  86.7  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 229 aa  86.7  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  36.8 
 
 		 229 aa  86.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 246 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 941 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>