More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0791 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0791  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  257  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3767  response regulator receiver protein  65.25 
 
 		 124 aa  170  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0858272 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  56.91 
 
 		 226 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.67 
 
 		 229 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  56.67 
 
 		 226 aa  147  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 228 aa  146  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 227 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  57.98 
 
 		 235 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  55.93 
 
 		 228 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  55 
 
 		 226 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 227 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  57.63 
 
 		 228 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  57.63 
 
 		 228 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  56.78 
 
 		 228 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  57.63 
 
 		 228 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  55.56 
 
 		 229 aa  144  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.97 
 
 		 237 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  57.26 
 
 		 228 aa  144  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  55.83 
 
 		 228 aa  144  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.83 
 
 		 233 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  55.65 
 
 		 228 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0657  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.82 
 
 		 235 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.000311431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.4 
 
 		 226 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  55.74 
 
 		 230 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.26 
 
 		 236 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  56.78 
 
 		 235 aa  142  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  55.93 
 
 		 227 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.3 
 
 		 229 aa  141  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  56.52 
 
 		 235 aa  141  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.47 
 
 		 231 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  56.52 
 
 		 235 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.83 
 
 		 226 aa  141  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  54.03 
 
 		 225 aa  141  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  53.39 
 
 		 229 aa  140  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  56.52 
 
 		 235 aa  141  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  56.52 
 
 		 235 aa  141  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.78 
 
 		 237 aa  140  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.17 
 
 		 226 aa  140  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  55 
 
 		 229 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.54 
 
 		 230 aa  140  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  52 
 
 		 237 aa  140  8e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  56.52 
 
 		 235 aa  139  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  56.52 
 
 		 235 aa  139  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  56.52 
 
 		 235 aa  139  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  56.52 
 
 		 235 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  56.52 
 
 		 235 aa  139  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  56.52 
 
 		 235 aa  139  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.78 
 
 		 226 aa  139  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  53.85 
 
 		 235 aa  139  9e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  56.52 
 
 		 235 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  51.24 
 
 		 231 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.14 
 
 		 230 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0896  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.17 
 
 		 226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232326  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  54.92 
 
 		 233 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  54.92 
 
 		 233 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  54.92 
 
 		 233 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.93 
 
 		 232 aa  137  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 226 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  54.24 
 
 		 236 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.42 
 
 		 223 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  50.41 
 
 		 231 aa  137  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.85 
 
 		 226 aa  137  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  48.78 
 
 		 229 aa  136  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  55.08 
 
 		 233 aa  136  7.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 226 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  54.31 
 
 		 227 aa  135  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  52.38 
 
 		 235 aa  135  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 226 aa  136  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.72 
 
 		 237 aa  134  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 		 227 aa  134  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0568  DNA-binding response regulator CreB  50 
 
 		 229 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391692  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.38 
 
 		 225 aa  133  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06060  DNA-binding response regulator CreB  50 
 
 		 229 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.22 
 
 		 230 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 229 aa  132  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.62 
 
 		 230 aa  133  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.03 
 
 		 238 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  54.24 
 
 		 234 aa  131  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5196  DNA-binding response regulator CreB  46.67 
 
 		 226 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  53.98 
 
 		 231 aa  131  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 		 234 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4871  DNA-binding response regulator CreB  46.67 
 
 		 226 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  normal  0.305164 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.14 
 
 		 226 aa  130  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  49.22 
 
 		 226 aa  130  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.28 
 
 		 239 aa  130  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  53.66 
 
 		 225 aa  130  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 228 aa  130  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 		 238 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 230 aa  130  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0360  DNA-binding response regulator CreB  46.67 
 
 		 226 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.48199  normal  0.18469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0357  DNA-binding response regulator CreB  45.83 
 
 		 226 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.501858  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  55.65 
 
 		 236 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  54.17 
 
 		 272 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.65 
 
 		 240 aa  129  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  49.17 
 
 		 232 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  52.54 
 
 		 231 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.85 
 
 		 225 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.76 
 
 		 247 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 232 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  54.31 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>