More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0668 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  81.88 
 
 		 165 aa  262  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  82.24 
 
 		 152 aa  250  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  68.49 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  75 
 
 		 167 aa  201  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  65.29 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  61.24 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  60.47 
 
 		 130 aa  174  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  64.66 
 
 		 145 aa  173  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  60 
 
 		 132 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  61.48 
 
 		 132 aa  168  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  55.4 
 
 		 147 aa  167  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  62.93 
 
 		 141 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  59.69 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  57.81 
 
 		 138 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  53.52 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  63.25 
 
 		 132 aa  165  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  60.33 
 
 		 135 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  60.33 
 
 		 135 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  56.49 
 
 		 132 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  60.83 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  54.89 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  57.03 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  53.91 
 
 		 130 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  62.28 
 
 		 130 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  57.26 
 
 		 129 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  62.28 
 
 		 130 aa  161  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  62.83 
 
 		 144 aa  161  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  59.35 
 
 		 134 aa  160  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  56.45 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  56.45 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  58.4 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  57.6 
 
 		 136 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  57.6 
 
 		 136 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  58.4 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  59.02 
 
 		 137 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  58.4 
 
 		 133 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  57.6 
 
 		 133 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  59.17 
 
 		 135 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 138 aa  156  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 138 aa  156  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  58.47 
 
 		 132 aa  153  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  57.26 
 
 		 117 aa  151  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 135 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 414 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 2539 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 405 aa  104  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  35 
 
 		 2458 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 417 aa  99.4  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  35 
 
 		 2476 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  37.96 
 
 		 347 aa  97.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 405 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 405 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 399 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 399 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  33.8 
 
 		 2301 aa  94  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 427 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 347 aa  93.2  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 2423 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.67 
 
 		 1992 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 423 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 121 aa  92.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 423 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  34.18 
 
 		 2284 aa  92  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 1629 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  35.71 
 
 		 1987 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2316  response regulator  37.82 
 
 		 527 aa  91.3  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000645629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  33.59 
 
 		 412 aa  90.9  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.97 
 
 		 2336 aa  90.9  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 227 aa  90.5  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 398 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 1646 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 1974 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 1646 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 457 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 123 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.2 
 
 		 227 aa  89.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  36.64 
 
 		 235 aa  89.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  35.4 
 
 		 1834 aa  89  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 345 aa  89.4  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  36.64 
 
 		 235 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 121 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 381 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 1832 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1568  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 476 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 1012 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  36.64 
 
 		 235 aa  89  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1473  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 477 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 236 aa  89  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1476  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 453 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832694  normal  0.439282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 1647 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  37.19 
 
 		 235 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  36.64 
 
 		 235 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  36.64 
 
 		 235 aa  88.2  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  36.64 
 
 		 235 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  36.64 
 
 		 235 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 1758 aa  88.2  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.93 
 
 		 1971 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>