More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2316 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2316  response regulator  100 
 
 		 527 aa  973    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000645629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2046  response regulator  62.41 
 
 		 404 aa  180  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0955  response regulator receiver domain-containing protein  63.33 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1798  response regulator receiver protein  62.5 
 
 		 421 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0425033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1568  response regulator receiver protein  65.32 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1473  response regulator receiver protein  64.52 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2391  response regulator receiver domain-containing protein  63.71 
 
 		 469 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1476  response regulator receiver protein  62.5 
 
 		 453 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832694  normal  0.439282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1530  response regulator receiver protein  58.68 
 
 		 405 aa  151  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2686  response regulator receiver protein  58.68 
 
 		 410 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000608002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0713  response regulator receiver protein  54.1 
 
 		 321 aa  143  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2486  response regulator receiver protein  53.72 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3476  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0690542  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 161 aa  97.1  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  39.85 
 
 		 165 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 133 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 152 aa  94  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  34.33 
 
 		 238 aa  93.6  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 133 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 133 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 145 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.89 
 
 		 231 aa  91.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  37.82 
 
 		 179 aa  91.3  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 133 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1319  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 129 aa  90.5  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 1559 aa  90.1  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  35.42 
 
 		 230 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 440 aa  89  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 122 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 		 1406 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 576 aa  88.2  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 167 aa  88.6  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 138 aa  87.8  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  87.4  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  37.29 
 
 		 160 aa  87  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 433 aa  87  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 133 aa  87  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  86.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  37.39 
 
 		 141 aa  86.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  33.91 
 
 		 132 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  54.74 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  34.35 
 
 		 231 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  30.21 
 
 		 229 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  28.57 
 
 		 239 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  28.57 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.22 
 
 		 223 aa  85.9  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  40.32 
 
 		 1299 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0072  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 934 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 2212 aa  84.7  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  31.93 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  34.45 
 
 		 123 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  36.21 
 
 		 132 aa  84  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 132 aa  84  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 		 1651 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  34.35 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.4 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.54 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 1287 aa  83.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 130 aa  83.6  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  38.84 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 228 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 147 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 121 aa  83.2  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  48.25 
 
 		 926 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 418 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 131 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 132 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 383 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 225 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 123 aa  83.2  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  31.93 
 
 		 2284 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 136 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  31.75 
 
 		 225 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 137 aa  82.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.54 
 
 		 239 aa  82.4  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 1322 aa  82.8  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 130 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 236 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  39.1 
 
 		 241 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 1832 aa  81.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 124 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  35.04 
 
 		 125 aa  81.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  34.78 
 
 		 136 aa  82  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 132 aa  82  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 129 aa  81.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 159 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  36.29 
 
 		 124 aa  82  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  36.97 
 
 		 123 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  31.43 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>