More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3476 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3476  response regulator receiver protein  100 
 
 		 412 aa  783    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0690542  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1568  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 476 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1473  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 477 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2391  response regulator receiver domain-containing protein  47.54 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1476  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832694  normal  0.439282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2316  response regulator  45.26 
 
 		 527 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000645629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2046  response regulator  34.78 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0955  response regulator receiver domain-containing protein  40.12 
 
 		 439 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1798  response regulator receiver protein  34.5 
 
 		 421 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0425033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0713  response regulator receiver protein  28.22 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2686  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000608002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2486  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1530  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  32.2 
 
 		 190 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  41.38 
 
 		 160 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 688 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  0.0000928264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 230 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 122 aa  87  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 230 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  34.17 
 
 		 234 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 234 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  39.1 
 
 		 167 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  36.21 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  36.21 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 235 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  36.21 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  36.21 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  36.21 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  36.21 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  36.21 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  36.21 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  36.21 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.65 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  37.17 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  38.32 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 230 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.91 
 
 		 236 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5453  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 747 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  38.53 
 
 		 141 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 129 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 125 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  28.76 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  29.87 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  29.87 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  37.16 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  34.19 
 
 		 121 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 143 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 132 aa  80.9  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 137 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  33.85 
 
 		 919 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  26.71 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0467  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117091  normal  0.827791 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3454  winged helix family two component transcriptional regulator  31.5 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3535  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 134 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283754  normal  0.0368978 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 165 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 152 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 239 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 147 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0244  CheA signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 747 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  28.89 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  36.21 
 
 		 123 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 124 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2186  CheA signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 768 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  40.37 
 
 		 179 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  28.89 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  28.89 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  28.89 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  28.89 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  28.89 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  28.89 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 132 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0504  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 129 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0548558  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 125 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 133 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  30.09 
 
 		 2026 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  37.17 
 
 		 136 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 133 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  33.63 
 
 		 134 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 2026 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 161 aa  77.8  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 140 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 133 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 		 1559 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>