More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5453 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  51.98 
 
 		 748 aa  648    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2839  response regulator receiver  52.5 
 
 		 748 aa  647    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5453  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 747 aa  1409    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0244  CheA signal transduction histidine kinase  85.45 
 
 		 747 aa  997    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2957  CheA signal transduction histidine kinase  51.47 
 
 		 758 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2186  CheA signal transduction histidine kinase  53.06 
 
 		 768 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3078  CheA signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 		 719 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 742 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 741 aa  320  7e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.72 
 
 		 734 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  30.51 
 
 		 764 aa  277  5e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 740 aa  270  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 783 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 781 aa  268  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 762 aa  264  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  37.12 
 
 		 878 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 686 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 784 aa  259  9e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 772 aa  257  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 706 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 755 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 777 aa  252  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 688 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  0.0000928264 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.86 
 
 		 1960 aa  246  8e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 695 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 1907 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  37.83 
 
 		 839 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.39 
 
 		 764 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 679 aa  242  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.55 
 
 		 763 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 756 aa  240  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 777 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 649 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  36.42 
 
 		 764 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  27.4 
 
 		 798 aa  239  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 679 aa  238  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 2164 aa  238  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  36.6 
 
 		 769 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  30.33 
 
 		 2026 aa  237  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 766 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 2026 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  29.62 
 
 		 1983 aa  236  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 		 952 aa  234  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 756 aa  234  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.61 
 
 		 1956 aa  233  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 767 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  25.5 
 
 		 769 aa  233  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  25.5 
 
 		 769 aa  232  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 801 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 1065 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  25.6 
 
 		 769 aa  231  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 765 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.94 
 
 		 764 aa  231  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 865 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 865 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 1012 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 769 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 762 aa  231  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  31.19 
 
 		 769 aa  231  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 1646 aa  230  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 1646 aa  230  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 1832 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 934 aa  229  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  29 
 
 		 2092 aa  229  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  32.07 
 
 		 864 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  28.5 
 
 		 1888 aa  228  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  32.07 
 
 		 864 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 707 aa  228  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.27 
 
 		 1180 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  34.05 
 
 		 768 aa  226  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.75 
 
 		 789 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 864 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  25.83 
 
 		 770 aa  226  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 864 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 864 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 1758 aa  226  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 864 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 911 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 760 aa  226  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 808 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 769 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 804 aa  225  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  32.45 
 
 		 832 aa  226  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 911 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 769 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.53 
 
 		 1866 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  34.06 
 
 		 1079 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  31.62 
 
 		 769 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  31.62 
 
 		 769 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  32.91 
 
 		 793 aa  223  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  26.65 
 
 		 2336 aa  223  8e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  29.75 
 
 		 1989 aa  223  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.15 
 
 		 1971 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 830 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  29.55 
 
 		 1970 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 896 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 2539 aa  220  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 2212 aa  220  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 896 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  33.65 
 
 		 1834 aa  219  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>