More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2186 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2839  response regulator receiver  54.2 
 
 
748 aa  673    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2186  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
768 aa  1445    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  54.64 
 
 
748 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2957  CheA signal transduction histidine kinase  57.4 
 
 
758 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5453  CheA signal transduction histidine kinase  48.17 
 
 
747 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0244  CheA signal transduction histidine kinase  51.41 
 
 
747 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3078  CheA signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
719 aa  344  4e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00446051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
777 aa  300  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  29.36 
 
 
764 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.69 
 
 
734 aa  280  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
742 aa  270  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
741 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
801 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
772 aa  264  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  30.21 
 
 
878 aa  263  8.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
784 aa  263  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
781 aa  256  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
777 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
762 aa  254  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
783 aa  249  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  28.39 
 
 
798 aa  249  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.29 
 
 
1960 aa  247  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
1907 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.27 
 
 
789 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
755 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
756 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
766 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
756 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.64 
 
 
764 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  38.51 
 
 
839 aa  239  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
695 aa  237  6e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  30.89 
 
 
2048 aa  236  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.76 
 
 
1866 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.96 
 
 
764 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  30 
 
 
1989 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.48 
 
 
769 aa  234  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
804 aa  234  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  32.89 
 
 
752 aa  233  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  31.25 
 
 
768 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  29.59 
 
 
1970 aa  231  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
740 aa  230  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.08 
 
 
1956 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  31.55 
 
 
793 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
2012 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
830 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
765 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  29.86 
 
 
764 aa  226  9e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  32.39 
 
 
832 aa  225  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
679 aa  224  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
767 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
762 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  29.52 
 
 
1834 aa  223  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
2009 aa  223  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 
679 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  25.83 
 
 
774 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.81 
 
 
763 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
707 aa  221  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  26.18 
 
 
2336 aa  220  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  33.76 
 
 
1643 aa  220  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
769 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
688 aa  220  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  0.0000928264 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  32.48 
 
 
864 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  32.07 
 
 
769 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
952 aa  219  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  32.48 
 
 
864 aa  220  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
808 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  32.32 
 
 
864 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  32.32 
 
 
864 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  32.32 
 
 
864 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  32.32 
 
 
864 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  32.5 
 
 
1079 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
989 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
769 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
941 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
2164 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
989 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
911 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  24.75 
 
 
769 aa  214  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  24.4 
 
 
770 aa  214  4.9999999999999996e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  24.49 
 
 
769 aa  214  5.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
911 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 
808 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  31.61 
 
 
2301 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  28.59 
 
 
865 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  29.46 
 
 
1983 aa  211  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  28.59 
 
 
865 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
2539 aa  211  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  27.3 
 
 
1987 aa  210  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
769 aa  210  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  25.35 
 
 
769 aa  209  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
896 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
896 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
1974 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  27.32 
 
 
2301 aa  210  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  30.88 
 
 
769 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  30.88 
 
 
769 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.27 
 
 
1180 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
706 aa  209  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
1065 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  25.66 
 
 
785 aa  208  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>