More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1798 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1798  response regulator receiver protein  100 
 
 		 421 aa  814    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0425033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0955  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2046  response regulator  49.1 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1530  response regulator receiver protein  56.25 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2486  response regulator receiver protein  40.97 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0713  response regulator receiver protein  40.05 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2686  response regulator receiver protein  53.78 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000608002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2316  response regulator  62.5 
 
 		 527 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000645629  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1568  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 476 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1476  response regulator receiver protein  57.02 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832694  normal  0.439282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2391  response regulator receiver domain-containing protein  57.5 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1473  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3476  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 412 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0690542  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  37.8 
 
 		 151 aa  99.8  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0072  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 934 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 503 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 369 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 122 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 227 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 121 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 121 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  33.33 
 
 		 980 aa  90.1  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1069  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 128 aa  90.5  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0511705  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  90.1  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  30.46 
 
 		 235 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 887 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 228 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 127 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.14 
 
 		 223 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  29.8 
 
 		 235 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  29.8 
 
 		 235 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  29.8 
 
 		 235 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  29.8 
 
 		 235 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  29.8 
 
 		 235 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  29.8 
 
 		 235 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  30.94 
 
 		 225 aa  87.4  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  29.8 
 
 		 235 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  29.8 
 
 		 235 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 231 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  29.8 
 
 		 235 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  34.03 
 
 		 231 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 238 aa  87.4  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 161 aa  87  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 374 aa  87  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.17 
 
 		 317 aa  87  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 228 aa  87  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.62 
 
 		 227 aa  87  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 232 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 231 aa  86.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 235 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 238 aa  86.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 576 aa  86.3  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.5 
 
 		 225 aa  86.3  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 234 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  36.13 
 
 		 250 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  36.13 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  36.13 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  36.13 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.63 
 
 		 223 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  36.13 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  36.13 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 121 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.51 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.82 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  36.13 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.82 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  36.13 
 
 		 250 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  36.13 
 
 		 250 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 579 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.71 
 
 		 231 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  29.55 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  36.29 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.62 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  34.43 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  34.51 
 
 		 1127 aa  84.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.71 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  31.17 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  32.62 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.3 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  29.17 
 
 		 2284 aa  84  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  34.51 
 
 		 1018 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  35.54 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 138 aa  84  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.89 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 566 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.85 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.21 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  27.33 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  23.56 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>