More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0072 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0072  response regulator receiver protein  100 
 
 		 934 aa  1769    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2486  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 385 aa  104  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1798  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 421 aa  99.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0425033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0713  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 321 aa  99  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2686  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 410 aa  97.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000608002 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0955  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 439 aa  96.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1530  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 405 aa  95.9  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1476  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 453 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832694  normal  0.439282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2046  response regulator  35.9 
 
 		 404 aa  92  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 146 aa  85.5  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1568  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1473  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 477 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2391  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 1390 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 1390 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 1390 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2316  response regulator  34.78 
 
 		 527 aa  81.6  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000645629  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 619 aa  81.3  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 133 aa  78.2  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  37.07 
 
 		 123 aa  77.8  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  34.4 
 
 		 234 aa  76.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 120 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  30.25 
 
 		 1989 aa  76.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7562  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 273 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.320599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 124 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  35.2 
 
 		 231 aa  75.9  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 133 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 121 aa  75.1  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  34.45 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.8 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 144 aa  74.7  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  29.02 
 
 		 235 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  29.02 
 
 		 235 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  29.02 
 
 		 235 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  29.02 
 
 		 235 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  29.02 
 
 		 235 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  29.02 
 
 		 235 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  29.02 
 
 		 235 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 1832 aa  73.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 226 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.45 
 
 		 1514 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  29.02 
 
 		 235 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1559 aa  73.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 124 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.45 
 
 		 1514 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 503 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  36.61 
 
 		 227 aa  73.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 133 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 133 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  33.05 
 
 		 125 aa  73.6  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.82 
 
 		 1956 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 302 aa  73.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 226 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 130 aa  73.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  32.46 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  29.23 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 228 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  31.09 
 
 		 132 aa  72.4  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  38.74 
 
 		 1018 aa  72  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 		 125 aa  72.4  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  36.7 
 
 		 123 aa  72.4  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0241  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 123 aa  72.4  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  31.58 
 
 		 243 aa  72  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29300  Response regulator  42.86 
 
 		 310 aa  72  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.85 
 
 		 229 aa  72  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 119 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4173  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  72  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.589597  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3661  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 226 aa  72  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  0.594777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  31.58 
 
 		 243 aa  72  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  29.46 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.35 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.3 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  32.09 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  29.65 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 136 aa  71.2  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>