More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0734 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  256  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2746  response regulator receiver protein  55.93 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0738  response regulator receiver protein  55.08 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1873  response regulator receiver protein  53.39 
 
 		 123 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1281  response regulator receiver domain-containing protein  49.15 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000906166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.76 
 
 		 237 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 229 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 229 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.97 
 
 		 230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 227 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.53 
 
 		 231 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.03 
 
 		 225 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.74 
 
 		 234 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 236 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 232 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  46.4 
 
 		 239 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 229 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.83 
 
 		 231 aa  104  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 229 aa  104  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.72 
 
 		 237 aa  104  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 229 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  46.4 
 
 		 229 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 229 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 229 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 229 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 229 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 229 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 230 aa  103  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  45.6 
 
 		 227 aa  103  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  44.17 
 
 		 123 aa  103  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0747  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  42.06 
 
 		 243 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 243 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 223 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 238 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  46.4 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  45.6 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 228 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  41.09 
 
 		 233 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  42.52 
 
 		 241 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  42.52 
 
 		 241 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  45.6 
 
 		 229 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2250  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.94 
 
 		 231 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 232 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.24 
 
 		 236 aa  99.4  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 233 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.32 
 
 		 1131 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.8 
 
 		 229 aa  99.4  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 239 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2641  two component transcriptional regulator  45.9 
 
 		 239 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  43.41 
 
 		 241 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 234 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 246 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 242 aa  98.6  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.28 
 
 		 231 aa  98.6  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 229 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 230 aa  99.4  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 242 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 234 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 241 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 231 aa  98.6  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 235 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  42.62 
 
 		 242 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 228 aa  97.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  43.9 
 
 		 230 aa  98.2  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 227 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  42.98 
 
 		 123 aa  98.2  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 238 aa  97.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  41.22 
 
 		 228 aa  97.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.46 
 
 		 244 aa  97.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 246 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.46 
 
 		 240 aa  97.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 227 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  43.09 
 
 		 229 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 278 aa  97.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 246 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  43.31 
 
 		 268 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 232 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  44.88 
 
 		 262 aa  97.4  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 236 aa  97.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 227 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 231 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 		 226 aa  97.1  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 234 aa  97.1  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>