More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0955 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0955  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 439 aa  843    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2046  response regulator  50.44 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1798  response regulator receiver protein  43.38 
 
 		 421 aa  296  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0425033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1530  response regulator receiver protein  55.36 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2686  response regulator receiver protein  77.78 
 
 		 410 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000608002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2486  response regulator receiver protein  70.08 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0713  response regulator receiver protein  63.85 
 
 		 321 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2316  response regulator  63.33 
 
 		 527 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000645629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2391  response regulator receiver domain-containing protein  56.2 
 
 		 469 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1473  response regulator receiver protein  55.47 
 
 		 477 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1476  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 453 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832694  normal  0.439282 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3476  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0690542  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 503 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  39.32 
 
 		 151 aa  96.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0072  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 934 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  33.12 
 
 		 235 aa  94  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 227 aa  93.6  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  32.5 
 
 		 235 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  32.5 
 
 		 235 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  32.61 
 
 		 238 aa  93.2  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 122 aa  93.2  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  34.43 
 
 		 2301 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  32.5 
 
 		 235 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  32.5 
 
 		 235 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  32.5 
 
 		 235 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  32.5 
 
 		 235 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  32.5 
 
 		 235 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  32.5 
 
 		 235 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  32.5 
 
 		 235 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 235 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  37.61 
 
 		 2284 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  36.75 
 
 		 2301 aa  90.1  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  35.83 
 
 		 462 aa  89.7  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 2212 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1429  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 122 aa  88.6  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  38.46 
 
 		 123 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.94 
 
 		 464 aa  88.2  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 227 aa  87.8  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  31.14 
 
 		 229 aa  87  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1319  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 129 aa  87  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 132 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1559 aa  86.7  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 500 aa  86.7  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.03 
 
 		 310 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  34.17 
 
 		 225 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.16 
 
 		 223 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  36.07 
 
 		 356 aa  86.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 145 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 123 aa  86.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.52 
 
 		 231 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 165 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 238 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 152 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 121 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  35.83 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.53 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 138 aa  84  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 127 aa  84  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  34.43 
 
 		 619 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.15 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 129 aa  84  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 129 aa  84  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  33.61 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 133 aa  83.6  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 1245 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  35.04 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  35.04 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  35.04 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  35.04 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  35.04 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  35.04 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  33.61 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  29.24 
 
 		 227 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  35.04 
 
 		 250 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0504  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 129 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0548558  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  35.04 
 
 		 250 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.76 
 
 		 238 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  33.88 
 
 		 229 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 566 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 228 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  35.04 
 
 		 250 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  31.09 
 
 		 179 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  39 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>