More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1555 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 225 aa  110  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.63 
 
 		 226 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.8 
 
 		 226 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  43.8 
 
 		 225 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 225 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 225 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 229 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1873  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  42.5 
 
 		 1414 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 257 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  43.97 
 
 		 1278 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  40.34 
 
 		 235 aa  101  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 242 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2746  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459198 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 231 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  41.18 
 
 		 242 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 226 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 242 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  39.5 
 
 		 242 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 227 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 228 aa  100  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  41.18 
 
 		 250 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  41.18 
 
 		 250 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 238 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 249 aa  99.4  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  38.84 
 
 		 242 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  41.18 
 
 		 250 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  41.18 
 
 		 242 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  41.18 
 
 		 238 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  41.18 
 
 		 238 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  41.18 
 
 		 238 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  41.18 
 
 		 238 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0738  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 246 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 225 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  41.18 
 
 		 238 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  41.18 
 
 		 238 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  45 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 229 aa  99.4  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 238 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  42.02 
 
 		 242 aa  98.6  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 237 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  40 
 
 		 163 aa  97.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  37.29 
 
 		 268 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  44.04 
 
 		 233 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1281  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000906166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 236 aa  97.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  42.5 
 
 		 231 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 227 aa  97.1  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 245 aa  97.1  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 240 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 246 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 246 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 227 aa  96.7  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 232 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.98 
 
 		 589 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 232 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 247 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 231 aa  96.7  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 232 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 216 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 231 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  35.54 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  38.66 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 259 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 262 aa  94.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 229 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 230 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  35.83 
 
 		 230 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  38.33 
 
 		 233 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  94.4  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  40.52 
 
 		 1324 aa  94.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 236 aa  94.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 226 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  40 
 
 		 230 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 230 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1406  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0894387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 231 aa  93.6  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>