More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1281 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1281  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
155 aa  322  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000906166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  49.15 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1873  response regulator receiver protein  47.97 
 
 
123 aa  130  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576406  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2746  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
120 aa  120  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0738  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  35.94 
 
 
140 aa  107  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  38.4 
 
 
229 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 
238 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  47.66 
 
 
238 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  47.66 
 
 
250 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  47.66 
 
 
238 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  47.66 
 
 
238 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  47.66 
 
 
238 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  47.66 
 
 
238 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  47.66 
 
 
238 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  47.66 
 
 
250 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  47.66 
 
 
250 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  41.86 
 
 
225 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
233 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  45.79 
 
 
238 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  40.83 
 
 
1344 aa  98.2  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 
224 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  38.02 
 
 
230 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  37.9 
 
 
126 aa  97.1  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  36.67 
 
 
121 aa  97.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.45 
 
 
225 aa  97.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 
234 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 
240 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 
244 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 
227 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 
225 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 
236 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2250  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 
231 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  40 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.71 
 
 
225 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 
231 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2641  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 
239 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 
226 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 
231 aa  95.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 
231 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  40.94 
 
 
241 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  40.94 
 
 
241 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 
226 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 
228 aa  94  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  41.86 
 
 
225 aa  94  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.76 
 
 
225 aa  94  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 
229 aa  94  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.45 
 
 
217 aa  93.6  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 
230 aa  93.6  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
523 aa  92.8  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 
230 aa  93.6  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 
229 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 
230 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0747  response regulator receiver protein  42.98 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.68 
 
 
225 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
231 aa  92  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
235 aa  91.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  35.77 
 
 
243 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  45.54 
 
 
1324 aa  92  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 
243 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 
229 aa  91.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 
236 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.12 
 
 
232 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1806  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.17 
 
 
229 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000153503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  37.6 
 
 
228 aa  91.3  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  37.04 
 
 
240 aa  90.9  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 
236 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1832  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 
229 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.372268  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 
232 aa  90.9  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2010  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 
229 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.93984e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1975  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 
229 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0483655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 
237 aa  90.9  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 
223 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  43.65 
 
 
227 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  43.22 
 
 
1278 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.25 
 
 
230 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2059  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 
229 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000985599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 
238 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  38.19 
 
 
1111 aa  90.1  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  42.37 
 
 
227 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.22 
 
 
231 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1047  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 
231 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 
227 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 
227 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0289  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 
232 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 
229 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 
227 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2504  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 
227 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2210  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 
227 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  42.37 
 
 
227 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  40 
 
 
352 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1789  alkaline phosphatase synthesis response regulator  39.32 
 
 
229 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.37 
 
 
227 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  41.53 
 
 
1128 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 
227 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  36.75 
 
 
230 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
128 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 
230 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  37.6 
 
 
228 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 
234 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>