More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1003 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  256  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  86.72 
 
 		 128 aa  218  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  67.52 
 
 		 125 aa  161  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  65.52 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  62.93 
 
 		 138 aa  150  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  64.96 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  52.29 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.22 
 
 		 1002 aa  105  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  45.38 
 
 		 225 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  45.38 
 
 		 225 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  45.38 
 
 		 254 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  45.38 
 
 		 254 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 245 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  44.54 
 
 		 254 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  45.38 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 245 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 257 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  42.62 
 
 		 242 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  43.7 
 
 		 254 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 242 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 247 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  43.7 
 
 		 228 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  45.38 
 
 		 225 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 246 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 234 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 246 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 249 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  44.25 
 
 		 229 aa  100  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  43.8 
 
 		 242 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  44.44 
 
 		 1888 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  45.79 
 
 		 225 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 246 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 236 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 263 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 229 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 247 aa  97.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  45.05 
 
 		 233 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.9 
 
 		 326 aa  95.9  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  95.9  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  43.33 
 
 		 242 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 231 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 231 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 216 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  46.55 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  42.4 
 
 		 229 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  39.2 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.4 
 
 		 767 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  39.17 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 242 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.4 
 
 		 237 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 229 aa  94.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  46.9 
 
 		 326 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 224 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 233 aa  94  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 229 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  41.67 
 
 		 242 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 227 aa  93.6  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 243 aa  93.6  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  43.55 
 
 		 229 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  41.67 
 
 		 242 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 231 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 232 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.74 
 
 		 231 aa  92  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 233 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 236 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 230 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  44.44 
 
 		 403 aa  92  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  41.59 
 
 		 265 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 223 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 239 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 223 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 239 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 239 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  47.41 
 
 		 247 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 227 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  44.76 
 
 		 317 aa  90.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 228 aa  90.9  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 365 aa  91.3  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  39.5 
 
 		 2070 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0821  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 232 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 229 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 231 aa  90.9  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 235 aa  90.5  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 223 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>