More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4952 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  100 
 
 		 317 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  30.96 
 
 		 875 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  30.46 
 
 		 735 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  30.79 
 
 		 718 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 714 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 713 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  46.92 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.51 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 246 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 246 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  45.16 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0794  two component transcriptional regulator  42.03 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.665518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.6 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  46.77 
 
 		 253 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.8 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  46.51 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 243 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  45.16 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 233 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 249 aa  109  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 243 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.53 
 
 		 263 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  46.22 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  46.22 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  45.11 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  41.84 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 240 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 246 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 242 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.9 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  42.45 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  46.28 
 
 		 247 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  42.97 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1931  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.72 
 
 		 227 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  47.46 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.94 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  46.22 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.63 
 
 		 231 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.19 
 
 		 227 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.33 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.96 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  45.76 
 
 		 248 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.4 
 
 		 231 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.74 
 
 		 223 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  43.31 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  48.33 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 231 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.73 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.31 
 
 		 1426 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  44.53 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4308  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.21 
 
 		 552 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  44.53 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2234  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.11 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  44.53 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  44.53 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.9 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  45.31 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4036  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  39.6 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  48.18 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 245 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.35 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  43.7 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  45.31 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  45.31 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  40.16 
 
 		 1177 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 223 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 223 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>