More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0627 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  100 
 
 		 163 aa  316  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 125 aa  120  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 129 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 128 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1196  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  40.88 
 
 		 247 aa  104  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.42 
 
 		 246 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.15 
 
 		 246 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.15 
 
 		 246 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  40.88 
 
 		 257 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 247 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 249 aa  100  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  41.01 
 
 		 231 aa  99.4  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 127 aa  99.8  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.42 
 
 		 263 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.5 
 
 		 311 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.5 
 
 		 311 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 121 aa  97.8  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 		 1002 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  35.37 
 
 		 229 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.35 
 
 		 326 aa  96.7  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2746  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 120 aa  96.3  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 229 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 132 aa  95.5  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.23 
 
 		 231 aa  95.5  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  40 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.55 
 
 		 227 aa  94.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  43.48 
 
 		 326 aa  94.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 225 aa  94  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 		 227 aa  94  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  44.35 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.64 
 
 		 231 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 887 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1134  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461969  hitchhiker  0.00297359 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 227 aa  92.8  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 233 aa  92  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  42.61 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  46.51 
 
 		 232 aa  91.7  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  38 
 
 		 231 aa  91.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0821  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 232 aa  91.7  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 272 aa  91.3  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  36.75 
 
 		 123 aa  91.3  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 278 aa  90.9  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 123 aa  90.9  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  37.75 
 
 		 230 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.48 
 
 		 226 aa  90.1  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  37.3 
 
 		 235 aa  89.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 236 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 227 aa  89.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0895  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 232 aa  89.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 232 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  43.44 
 
 		 243 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 394 aa  88.6  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 254 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1095  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 138 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1223  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1155  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  40.32 
 
 		 233 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 369 aa  87.8  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 233 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3567  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  38.1 
 
 		 228 aa  87.8  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 576 aa  87.8  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  39.13 
 
 		 268 aa  87.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 231 aa  87.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 231 aa  87.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.02 
 
 		 239 aa  87  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1319  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 129 aa  87  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  36.22 
 
 		 230 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0738  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 237 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.02 
 
 		 234 aa  87  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 234 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2841  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.61 
 
 		 308 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0622  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 		 240 aa  86.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 224 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 245 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  40.83 
 
 		 1177 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 236 aa  86.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1275  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.13 
 
 		 304 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00827298  normal  0.435617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.32 
 
 		 237 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 230 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  41.74 
 
 		 254 aa  86.3  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  36.92 
 
 		 229 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  40.88 
 
 		 255 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1281  response regulator receiver domain-containing protein  32.82 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000906166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>