More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0766 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2558  two component transcriptional regulator  57.92 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2245  two component transcriptional regulator  52.59 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  55.05 
 
 		 240 aa  231  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2600  two component transcriptional regulator  56.96 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1386  two component transcriptional regulator  56 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_004310  BR1521  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  52.65 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1472  putative transcriptional regulatory protein OmpR  52.65 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.830233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1644  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 235 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2511  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.74 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4852  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.75 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2788  two component transcriptional regulator  56.14 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2269  two component transcriptional regulator  55.91 
 
 		 243 aa  222  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1138  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1737  two component transcriptional regulator  52.86 
 
 		 243 aa  222  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151372  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2799  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0852  two component transcriptional regulator  57.52 
 
 		 231 aa  222  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0690944  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3164  two component response regulator  54.3 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0516901  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3299  DNA-binding response regulator PetR  54.98 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4173  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 241 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.589597  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0989  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 234 aa  221  8e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.016967  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  53.3 
 
 		 273 aa  221  9e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3884  winged helix family two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2924  two component transcriptional regulator  54.15 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0092  two component transcriptional regulator  53.25 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4069  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2518  two-component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2225  two component transcriptional regulator  55.95 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3137  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 242 aa  215  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4351  two component transcriptional regulator  57.59 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2585  response regulator receiver  52.19 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2808  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.75 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2613  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.32 
 
 		 242 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  45.41 
 
 		 238 aa  188  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  46.12 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6015  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  47.41 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7272  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.04 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629561  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  44.87 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  44.87 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  44.87 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  45.3 
 
 		 241 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  45.3 
 
 		 241 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  45.3 
 
 		 241 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  43.48 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  44.44 
 
 		 240 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  44.87 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  43.91 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  44.81 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  43.91 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.42 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  44.87 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  43.64 
 
 		 245 aa  179  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  44.54 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  45.87 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  45.87 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  43.64 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  46.35 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  43.35 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  45 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  43.59 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  43.35 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  46.28 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  46.28 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  44.21 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  44.87 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1574  osmolarity response regulator  45.09 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  45.87 
 
 		 243 aa  175  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  43.16 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5598  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 249 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122257  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5962  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 249 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  42.13 
 
 		 239 aa  174  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  41.63 
 
 		 239 aa  174  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 230 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  42.13 
 
 		 239 aa  174  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5849  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  44.58 
 
 		 243 aa  174  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  41.45 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2404  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  43.98 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  44.58 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6462  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.747199 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  41.7 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  41.03 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  41.7 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  41.03 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  41.03 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0107  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0108  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  41.03 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  41.03 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  41.03 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  41.03 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  41.7 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>