More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2225 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2225  two component transcriptional regulator  100 
 
 
246 aa  474  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1138  two component transcriptional regulator  56.12 
 
 
232 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2799  two component transcriptional regulator  56.12 
 
 
232 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2788  two component transcriptional regulator  56.72 
 
 
232 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  56.78 
 
 
240 aa  239  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1472  putative transcriptional regulatory protein OmpR  51.65 
 
 
241 aa  232  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.830233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1521  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  51.65 
 
 
241 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1644  two component transcriptional regulator  53.48 
 
 
235 aa  231  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0989  DNA-binding response regulator  51.71 
 
 
234 aa  228  5e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.016967  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0092  two component transcriptional regulator  52.12 
 
 
239 aa  228  6e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3164  two component response regulator  54.55 
 
 
232 aa  224  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0516901  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0852  two component transcriptional regulator  56.09 
 
 
231 aa  224  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0690944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.14 
 
 
233 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.14 
 
 
233 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3299  DNA-binding response regulator PetR  55.7 
 
 
237 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2269  two component transcriptional regulator  54.7 
 
 
243 aa  221  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2558  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 
239 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2245  two component transcriptional regulator  52.59 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398974  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2600  two component transcriptional regulator  54.04 
 
 
239 aa  218  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2924  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 
234 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.470238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2511  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.65 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  55.36 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3884  winged helix family two component transcriptional regulator  51.45 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4852  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.1 
 
 
240 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1386  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 
241 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4173  two component transcriptional regulator  50.83 
 
 
241 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.589597  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2518  two-component transcriptional regulator  49.57 
 
 
246 aa  208  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  49.39 
 
 
273 aa  208  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1737  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 
243 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151372  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3137  two component transcriptional regulator  50 
 
 
242 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2585  response regulator receiver  52.48 
 
 
242 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2808  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.48 
 
 
242 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2613  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.95 
 
 
242 aa  201  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4351  two component transcriptional regulator  57.83 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4069  two component transcriptional regulator  52.63 
 
 
235 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.15 
 
 
244 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  45.11 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7272  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.65 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  45.11 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  45.11 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  45.11 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  45.11 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  45.11 
 
 
241 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  44.68 
 
 
241 aa  182  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  44.68 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  44.26 
 
 
239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  45.96 
 
 
241 aa  181  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  45.11 
 
 
241 aa  181  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  44.26 
 
 
239 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  43.83 
 
 
241 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6015  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 
240 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  43.59 
 
 
240 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  44.26 
 
 
240 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  44.3 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  43.4 
 
 
239 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.4 
 
 
239 aa  178  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
239 aa  178  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  43.83 
 
 
241 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  46.98 
 
 
243 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05120  osmolarity response regulator  44.58 
 
 
246 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  43.4 
 
 
241 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  43.93 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.8 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0107  DNA-binding response regulator  44.49 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  42.55 
 
 
239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0108  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  45.69 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  44.77 
 
 
245 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  45 
 
 
243 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 
245 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  45.89 
 
 
244 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 
239 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 
234 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 
234 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  44.92 
 
 
245 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  42.37 
 
 
240 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  42.98 
 
 
240 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>