More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2107 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  99.59 
 
 		 245 aa  487  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  100 
 
 		 245 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  57.14 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.72 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  55.19 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.6 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  53.75 
 
 		 251 aa  268  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.25 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  54.24 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  52.72 
 
 		 238 aa  261  6.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  53.94 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  52.97 
 
 		 236 aa  257  9e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.68 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 262 aa  256  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  52.3 
 
 		 238 aa  255  5e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  52.1 
 
 		 237 aa  255  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  52.48 
 
 		 243 aa  254  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  52.1 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  51.28 
 
 		 246 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  53.19 
 
 		 244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.85 
 
 		 275 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  53.14 
 
 		 239 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.27 
 
 		 239 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.23 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  52.48 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  53.16 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  51.24 
 
 		 240 aa  241  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  51.24 
 
 		 240 aa  241  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 249 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  50.2 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.41 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  52.12 
 
 		 243 aa  234  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  47.7 
 
 		 241 aa  234  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.84 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  48.73 
 
 		 245 aa  233  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  50.43 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  50.85 
 
 		 243 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  50.85 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  49.6 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.9 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  50.85 
 
 		 243 aa  232  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  50.85 
 
 		 243 aa  232  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  48.95 
 
 		 240 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 246 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.38 
 
 		 246 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  50.42 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.38 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  49.38 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  48.55 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  51.28 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  48.96 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 		 237 aa  228  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.17 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  51.03 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  49.15 
 
 		 243 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  46.28 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.72 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  49.36 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  48.35 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  48.96 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.57 
 
 		 259 aa  225  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  51.05 
 
 		 245 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  46.78 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.35 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1574  osmolarity response regulator  50.89 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  47.9 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  47.88 
 
 		 248 aa  222  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  47.9 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  47.52 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  47.52 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2497  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 		 239 aa  221  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.54 
 
 		 245 aa  221  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  49.15 
 
 		 243 aa  221  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.5 
 
 		 242 aa  221  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.37 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  45.27 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  46.86 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  46.86 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  47.9 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  47.03 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  47.46 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  47.46 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>