More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2558 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2558  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1386  two component transcriptional regulator  69.26 
 
 		 241 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4852  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.2 
 
 		 240 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1737  two component transcriptional regulator  69.57 
 
 		 243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151372  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2518  two-component transcriptional regulator  66.1 
 
 		 246 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3884  winged helix family two component transcriptional regulator  68.91 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4173  two component transcriptional regulator  67.23 
 
 		 241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.589597  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3137  two component transcriptional regulator  64.83 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2511  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.11 
 
 		 244 aa  291  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1521  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  60.76 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1472  putative transcriptional regulatory protein OmpR  60.76 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.830233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1644  two component transcriptional regulator  61.95 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  63.56 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0989  DNA-binding response regulator  57.52 
 
 		 234 aa  275  6e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.016967  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  62.81 
 
 		 273 aa  274  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4069  two component transcriptional regulator  63.03 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2245  two component transcriptional regulator  57.83 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.52 
 
 		 233 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.52 
 
 		 233 aa  264  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3164  two component response regulator  58.41 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0516901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2808  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.83 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2613  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.41 
 
 		 242 aa  261  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2585  response regulator receiver  61.41 
 
 		 242 aa  261  8e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2269  two component transcriptional regulator  60.94 
 
 		 243 aa  258  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2788  two component transcriptional regulator  56.96 
 
 		 232 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1138  two component transcriptional regulator  57.59 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2799  two component transcriptional regulator  57.59 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6015  two component transcriptional regulator  62.76 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7272  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.74 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629561  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  57.92 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2600  two component transcriptional regulator  52.3 
 
 		 239 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0092  two component transcriptional regulator  50.65 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2924  two component transcriptional regulator  53.48 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470238 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3299  DNA-binding response regulator PetR  52.54 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2225  two component transcriptional regulator  52.67 
 
 		 246 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4351  two component transcriptional regulator  58.56 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  47.66 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  46.81 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  46.81 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0852  two component transcriptional regulator  52.63 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0690944  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  46.81 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  47.66 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  45.53 
 
 		 241 aa  188  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 241 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 241 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 241 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  45.53 
 
 		 241 aa  188  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  45.3 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  45.3 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  47.37 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  47.14 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  47.14 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  47.14 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  47.37 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  47.58 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  47.14 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  47.14 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  47.14 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  45.73 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  45.65 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  44.31 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  46.7 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.8 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.04 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  45.18 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  46.05 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  44.54 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05120  osmolarity response regulator  44.08 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  44.35 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  44.49 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  44.49 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  47.32 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.5 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  47.19 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>