More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1196 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1196  response regulator receiver protein  100 
 
 		 119 aa  228  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  45 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 128 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 234 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.17 
 
 		 236 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  40 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2746  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0130  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 229 aa  80.9  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 		 223 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 		 223 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 223 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  38.02 
 
 		 231 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 238 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 223 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 223 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 229 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 223 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 223 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.17 
 
 		 229 aa  80.1  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 223 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 223 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 237 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  38.26 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 249 aa  78.2  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1873  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 236 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.45 
 
 		 326 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 234 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 247 aa  77.4  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 234 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 236 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  39.45 
 
 		 326 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 237 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2641  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0738  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.52 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  36.52 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 244 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2504  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2210  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 239 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.26 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  38.26 
 
 		 268 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 265 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 262 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 260 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  38.26 
 
 		 260 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  38.26 
 
 		 265 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 236 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.96 
 
 		 392 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  38.26 
 
 		 260 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 236 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  38.26 
 
 		 260 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 227 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>