More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2641 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2641  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.45 
 
 		 237 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2250  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.48 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0895  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.7 
 
 		 232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2210  DNA-binding response regulator  52.81 
 
 		 227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2504  DNA-binding response regulator  52.81 
 
 		 227 aa  241  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1832  DNA-binding response regulator  50.43 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.372268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1975  DNA-binding response regulator  50.43 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0483655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2010  DNA-binding response regulator  50.43 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.93984e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  50.65 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1806  alkaline phosphatase synthesis response regulator  50 
 
 		 229 aa  238  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000153503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1789  alkaline phosphatase synthesis response regulator  49.57 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2059  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000985599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.03 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5586  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  47.88 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 239 aa  188  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  43.59 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  43.59 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  43.59 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  43.59 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  43.59 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  43.59 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  43.59 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  43.59 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  43.59 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 237 aa  184  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 		 234 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 236 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  42.11 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  41.45 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.73 
 
 		 227 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 247 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 226 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.77 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 		 239 aa  181  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.95 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.1 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  38.63 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  41.3 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 242 aa  178  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 242 aa  179  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 226 aa  178  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  41.85 
 
 		 233 aa  178  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 225 aa  178  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 233 aa  178  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 231 aa  177  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  42.74 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  38.7 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  43.48 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 250 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  41.48 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  41.85 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  40.85 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.45 
 
 		 226 aa  175  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 224 aa  175  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>