More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2250 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2250  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 231 aa  463  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2210  DNA-binding response regulator  61.67 
 
 		 227 aa  295  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2504  DNA-binding response regulator  61.23 
 
 		 227 aa  294  7e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.61 
 
 		 237 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0895  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.22 
 
 		 232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2641  two component transcriptional regulator  53.48 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.75 
 
 		 237 aa  234  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1789  alkaline phosphatase synthesis response regulator  50 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1806  alkaline phosphatase synthesis response regulator  49.12 
 
 		 229 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000153503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1832  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.372268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1975  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0483655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2010  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.93984e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2059  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000985599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5586  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 225 aa  211  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  46.12 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  46.12 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  46.12 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  46.12 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  46.12 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  46.12 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  46.12 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  46.12 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  45.69 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.74 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  42.92 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  43.91 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 		 236 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  46.55 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  46.55 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  41.13 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  41.13 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  40.69 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  40.69 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  40.69 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.69 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.69 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  40.69 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  40.69 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  42.98 
 
 		 234 aa  184  7e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.02 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>