More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1436 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  247  3e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0289  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0549  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1370  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 235 aa  97.1  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  36.59 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.69 
 
 		 250 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 230 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 230 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 230 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.38 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.816358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 235 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  40.8 
 
 		 352 aa  93.6  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.93 
 
 		 250 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 163 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 229 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  39.52 
 
 		 980 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  41.18 
 
 		 403 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 		 352 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  33.59 
 
 		 231 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 230 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 576 aa  90.5  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 239 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  41.18 
 
 		 123 aa  90.5  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.01 
 
 		 354 aa  90.5  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2044  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0300859  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 229 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  38.21 
 
 		 934 aa  89.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.68 
 
 		 226 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 227 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 234 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.86 
 
 		 225 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.59 
 
 		 230 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 234 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 240 aa  88.2  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 123 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 225 aa  88.2  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 		 240 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.92 
 
 		 236 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2103  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 		 240 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0666731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 234 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  39.84 
 
 		 234 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2355  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  40.48 
 
 		 235 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  40.48 
 
 		 235 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  40.48 
 
 		 235 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  40.48 
 
 		 235 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  40.48 
 
 		 235 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  40.48 
 
 		 235 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  40.48 
 
 		 235 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0648  diguanylate phosphodiesterase  38.46 
 
 		 403 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1805  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0171  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  32.54 
 
 		 231 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 232 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 217 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 237 aa  86.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 227 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 		 232 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 231 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  40.48 
 
 		 235 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  40.48 
 
 		 235 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0746  response regulator receiver  36.51 
 
 		 228 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 		 247 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  34.13 
 
 		 230 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 229 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 224 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 249 aa  85.5  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 365 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0730  two component transcriptional regulator  36.51 
 
 		 228 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.19 
 
 		 231 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  41.82 
 
 		 356 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.13 
 
 		 227 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 248 aa  85.5  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 355 aa  85.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  36.51 
 
 		 257 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0365  DNA-binding response regulator SaeR  37.5 
 
 		 229 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  34.96 
 
 		 241 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 223 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4115  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 311 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 236 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>