More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5215 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  72.33 
 
 		 225 aa  314  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  72.68 
 
 		 225 aa  314  8e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 215 aa  300  9e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.81 
 
 		 216 aa  298  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.74 
 
 		 212 aa  298  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.81 
 
 		 216 aa  298  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 231 aa  174  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 226 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 245 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.77 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.77 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.18 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  38.94 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  38.5 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 227 aa  154  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  36.89 
 
 		 242 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  36.89 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  36.44 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  37.05 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11994  diatom response regulator 2  32.56 
 
 		 222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  36.23 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.34 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.59 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  31.98 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2180  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.39 
 
 		 220 aa  118  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  42.4 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.83 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  31.53 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.69 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  43.65 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  35.58 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  35.58 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  36.06 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  36.06 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  30.66 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  31.43 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  30.39 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  35.58 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  35.58 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  35.58 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  30.29 
 
 		 229 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  29.81 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1016  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.65 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.31 
 
 		 443 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.09 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  30.99 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.47 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.82 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.81 
 
 		 326 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.84 
 
 		 240 aa  112  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  36.23 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.54 
 
 		 354 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  37.88 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.69 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  31.92 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.53 
 
 		 443 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  38.35 
 
 		 326 aa  111  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  29.9 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  42.07 
 
 		 1374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  31.92 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.06 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  29.95 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  32.39 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  42.4 
 
 		 257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  42.4 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.1 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  31.46 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  31.46 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  31.1 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  32.85 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  31.92 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  31.46 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.43 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.54 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.12 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>