More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27620 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_27620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  100 
 
 		 125 aa  243  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.816358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.04 
 
 		 254 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  53.91 
 
 		 250 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1781  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 200 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.28 
 
 		 248 aa  120  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2937  two component transcriptional regulator  45.9 
 
 		 255 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.511337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 264 aa  117  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  43.09 
 
 		 260 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01450  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.86 
 
 		 320 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.610434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2906  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 277 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 378 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 265 aa  107  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3656  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 275 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.09 
 
 		 232 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  44.83 
 
 		 244 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  44.83 
 
 		 244 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3261  response regulator receiver  46.55 
 
 		 295 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2828  response regulator receiver  42.86 
 
 		 231 aa  103  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 229 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  42.86 
 
 		 250 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3500  response regulator receiver  40.52 
 
 		 356 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 224 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2179  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 234 aa  100  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 259 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 225 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 230 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 231 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 371 aa  99  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 230 aa  98.6  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 235 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 227 aa  98.2  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 234 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.32 
 
 		 236 aa  98.6  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 229 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  47.47 
 
 		 230 aa  97.8  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  43.86 
 
 		 248 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  46.28 
 
 		 236 aa  97.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 227 aa  97.1  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  42.24 
 
 		 297 aa  97.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 227 aa  97.1  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 247 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 226 aa  97.1  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 217 aa  96.7  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  43.09 
 
 		 229 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.28 
 
 		 226 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  42.24 
 
 		 248 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 243 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 243 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.54 
 
 		 231 aa  96.7  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 261 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 243 aa  96.7  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  41.38 
 
 		 233 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  41.32 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 232 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.01 
 
 		 230 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.48 
 
 		 237 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  40.16 
 
 		 233 aa  95.5  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 245 aa  95.9  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 234 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  43.86 
 
 		 256 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  39.52 
 
 		 231 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 232 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 229 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 237 aa  94.7  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 234 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 226 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  43.7 
 
 		 247 aa  94.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4259  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 230 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 243 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 234 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 129 aa  94.4  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 243 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 241 aa  94.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 236 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 244 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 		 230 aa  94  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 248 aa  94  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.34 
 
 		 239 aa  94.4  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 232 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0977  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 242 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3557  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.04 
 
 		 230 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 255 aa  94  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 242 aa  94  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  42.24 
 
 		 248 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0224  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.94 
 
 		 243 aa  93.6  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 242 aa  93.6  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 235 aa  93.6  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.92 
 
 		 233 aa  93.6  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 242 aa  93.2  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.49 
 
 		 235 aa  93.2  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 229 aa  93.6  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 234 aa  93.6  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  42.28 
 
 		 260 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  43.2 
 
 		 241 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 245 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 256 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  43.2 
 
 		 237 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>