More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2355 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2355  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 576 aa  98.2  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.54 
 
 		 348 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 365 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.45 
 
 		 354 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 247 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 204 aa  90.1  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.72 
 
 		 352 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 216 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 216 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 579 aa  90.1  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 231 aa  88.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 245 aa  88.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  42.31 
 
 		 352 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.32 
 
 		 350 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 248 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2980  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 138 aa  87  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  40.19 
 
 		 231 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.83 
 
 		 221 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 216 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  40.38 
 
 		 225 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 225 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 233 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  35 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 229 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 217 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 242 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.66 
 
 		 212 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  35.29 
 
 		 242 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  34.65 
 
 		 242 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 242 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0463  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  37.61 
 
 		 403 aa  83.6  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  35.9 
 
 		 1388 aa  83.6  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  41.38 
 
 		 1366 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  36.21 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  33.01 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5315  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.813269  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  36.13 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  41.28 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 355 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.83 
 
 		 385 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.71 
 
 		 1499 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 		 403 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  38.1 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1956  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000121146  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  36.8 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 		 474 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3078  CheA signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 719 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446051 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  39.42 
 
 		 236 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 394 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 230 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  36.97 
 
 		 251 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.04 
 
 		 220 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  35.45 
 
 		 196 aa  80.5  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  37.93 
 
 		 980 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 1631 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3975  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44357  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1651 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.51 
 
 		 589 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0648  diguanylate phosphodiesterase  32.8 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 1559 aa  79.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  37.39 
 
 		 1207 aa  79.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  39.32 
 
 		 1298 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  34.65 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  40.52 
 
 		 1373 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>