More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5055 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  95.07 
 
 		 223 aa  434  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  94.62 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  94.62 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  94.17 
 
 		 223 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  93.72 
 
 		 223 aa  427  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  93.27 
 
 		 223 aa  428  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  93.27 
 
 		 223 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  93.72 
 
 		 223 aa  427  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  94.17 
 
 		 223 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  88.79 
 
 		 223 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0226  DNA-binding response regulator  51.77 
 
 		 223 aa  221  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0226  DNA-binding response regulator  51.77 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 235 aa  191  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  43.95 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  43.5 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 235 aa  188  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 406 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  40.81 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 247 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  43.48 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  43.72 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  43.48 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.48 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.48 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  43.72 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  43.48 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  44.93 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  44.93 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  43.48 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  43.48 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2250  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  44.1 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 235 aa  178  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 237 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 242 aa  177  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  43.48 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  44.49 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  44.49 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  44.49 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>