More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1560 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  255  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  82.4 
 
 		 125 aa  204  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  73.73 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  64.96 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  62.39 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  58.62 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  42.06 
 
 		 229 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 263 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1534  phosphate regulon two-component response regulator transcription regulator protein  43.48 
 
 		 237 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 237 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 247 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1713  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  43.48 
 
 		 237 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0484795  normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 249 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 241 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  46.51 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 257 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 232 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 1341 aa  100  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 		 231 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 216 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  37.07 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  46.49 
 
 		 232 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 226 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 247 aa  99.4  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 		 231 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  42.24 
 
 		 236 aa  98.6  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 223 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  40.32 
 
 		 229 aa  98.2  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 236 aa  97.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 246 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 246 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4448  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 233 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 245 aa  97.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 233 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2015  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 233 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0824  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 233 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1276  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 233 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 233 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1194  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 233 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.484581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0887  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 233 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  0.0397846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2853  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 233 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1271  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 233 aa  97.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624894  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 246 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  40.87 
 
 		 235 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.54 
 
 		 326 aa  97.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  47.01 
 
 		 223 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 229 aa  97.1  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 235 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  97.1  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1490  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.87 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0785  DNA-binding response regulator PhoB  40.87 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1623  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.87 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2768  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.87 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.368066  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  42.28 
 
 		 272 aa  97.1  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1520  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.87 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1296  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.87 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0572  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.87 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0579  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.87 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0503015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 223 aa  96.7  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 228 aa  96.7  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 240 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 233 aa  96.7  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 240 aa  95.9  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.04 
 
 		 767 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 234 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  95.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.1 
 
 		 1866 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 245 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  45.54 
 
 		 326 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  43.22 
 
 		 242 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 233 aa  95.5  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.87 
 
 		 236 aa  94.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  38.53 
 
 		 356 aa  94.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 242 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 235 aa  95.1  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 235 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 225 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  45.3 
 
 		 454 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  39.66 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 806 aa  94.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 242 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 229 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  40.52 
 
 		 242 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>