More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1930 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  57.64 
 
 		 230 aa  268  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  45.85 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 239 aa  203  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  46.29 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  45.85 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.85 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.13 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.21 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 229 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.98 
 
 		 236 aa  194  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  44.54 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  44.54 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  46.52 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44.69 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  46.02 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  44.69 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 236 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 229 aa  191  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 226 aa  191  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  44.44 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  44.69 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  42.49 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 231 aa  188  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0289  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126796  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1194  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.484581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  42.98 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  43.35 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  43.35 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0824  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1276  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0887  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  0.0397846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  43.46 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>