More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6875 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  260  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  48 
 
 		 248 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 		 243 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  46.77 
 
 		 290 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  47.2 
 
 		 248 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  46.22 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  47.2 
 
 		 248 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  46.77 
 
 		 269 aa  98.6  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 242 aa  98.6  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 246 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 242 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0280  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 295 aa  98.2  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.932912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 247 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 259 aa  97.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  49.57 
 
 		 246 aa  97.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  47.2 
 
 		 248 aa  97.1  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  46.4 
 
 		 248 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  38.71 
 
 		 1373 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  47.41 
 
 		 248 aa  95.9  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  46.72 
 
 		 248 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  46.72 
 
 		 248 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  43.7 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  45.97 
 
 		 248 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 248 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  46.72 
 
 		 248 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  47.01 
 
 		 248 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  46.55 
 
 		 248 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.79 
 
 		 236 aa  94.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 243 aa  94.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 243 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 243 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  47.46 
 
 		 244 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  44.53 
 
 		 253 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 255 aa  93.6  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.68 
 
 		 326 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 317 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 253 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 230 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 230 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  40.68 
 
 		 326 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.38 
 
 		 235 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  38.79 
 
 		 1311 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  35.83 
 
 		 705 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.43 
 
 		 488 aa  90.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 229 aa  90.5  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  42.72 
 
 		 239 aa  90.5  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 229 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.38 
 
 		 236 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2286  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 263 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000997036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  40 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  43.12 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 		 230 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  44.66 
 
 		 235 aa  89  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  41.03 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  40.34 
 
 		 1177 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.37 
 
 		 242 aa  87.4  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 		 721 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 230 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.27 
 
 		 227 aa  87  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 270 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 229 aa  87  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  41.75 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 225 aa  87  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.21 
 
 		 243 aa  86.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 231 aa  87  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  86.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 225 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.45 
 
 		 230 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 984 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.45 
 
 		 230 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  40 
 
 		 121 aa  85.9  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  39.45 
 
 		 230 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 231 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.66 
 
 		 310 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  37.61 
 
 		 705 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 232 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 232 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 232 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>