More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2286 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2286  response regulator receiver protein  100 
 
 		 263 aa  523  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000997036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1527  response regulator receiver protein  74.32 
 
 		 257 aa  328  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0584  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  48.57 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.53 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  47.93 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  51.22 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 232 aa  125  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.97 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  46.34 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  46.34 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  46.34 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  46.34 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  46.34 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  46.34 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  50 
 
 		 166 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  46.34 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.2 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  45.67 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  46.34 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  46.34 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  46.34 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  46.34 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.9 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0223  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 315 aa  122  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  46.22 
 
 		 225 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 225 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.33 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0562  response regulator  46.22 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  44.36 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.45 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.86 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.59 
 
 		 224 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  46.55 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.2 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.57 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.04 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0687  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 225 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 		 225 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 229 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  46.96 
 
 		 233 aa  118  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.33 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  46.55 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 229 aa  118  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  47.29 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.17 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  49.19 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  47.5 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4036  two component transcriptional regulator  43.94 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.31 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.28 
 
 		 243 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.97 
 
 		 234 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4249  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 225 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.316157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.57 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  48.72 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.59 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  41.61 
 
 		 233 aa  116  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  45 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.33 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  42.75 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 225 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.03 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.42 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  39.88 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  48.33 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  40.88 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  40.88 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  48.33 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0791  response regulator receiver domain-containing protein  47.83 
 
 		 125 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 232 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0254  DNA-binding response regulator  42.66 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000466037 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0213  DNA-binding response regulator  42.66 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  46.61 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  43.33 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30940  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  48.57 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  44.63 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  42.65 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.54 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1752  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.53 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>