More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4036 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4036  two component transcriptional regulator  100 
 
 
248 aa  501  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  69.39 
 
 
245 aa  371  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  69.8 
 
 
245 aa  368  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.12 
 
 
247 aa  337  7e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 
239 aa  221  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 
239 aa  221  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  46.38 
 
 
239 aa  208  6e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 
229 aa  205  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 
261 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 
230 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  46.49 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 
229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 
224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 
242 aa  198  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 
235 aa  198  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 
239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 
224 aa  195  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.51 
 
 
223 aa  195  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  44.35 
 
 
242 aa  194  8.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 
230 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  44.12 
 
 
240 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  46.85 
 
 
225 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 
242 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.37 
 
 
231 aa  193  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 
227 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  43.86 
 
 
256 aa  192  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 
247 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 
230 aa  192  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 
230 aa  191  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 
248 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 
243 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
229 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.61 
 
 
239 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.05 
 
 
226 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  44.16 
 
 
248 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 
226 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 
248 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  45.33 
 
 
248 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  43.72 
 
 
248 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
229 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  42.67 
 
 
248 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 
229 aa  188  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 
226 aa  188  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  43.29 
 
 
248 aa  188  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  45.45 
 
 
229 aa  188  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
233 aa  188  9e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 
243 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 
230 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 
236 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 
230 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 
243 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  42.86 
 
 
248 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 
242 aa  186  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30940  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.43 
 
 
225 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4249  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 
225 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.316157  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  44.74 
 
 
235 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1347  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 
228 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1365  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 
228 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1381  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 
228 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 
234 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 
259 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 
235 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  44.74 
 
 
235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  44.74 
 
 
235 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  44.74 
 
 
235 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  44.74 
 
 
235 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  44.74 
 
 
235 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  44.74 
 
 
235 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  44.74 
 
 
235 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  44.74 
 
 
235 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 
235 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 
248 aa  185  5e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 
227 aa  185  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 
226 aa  185  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 
229 aa  185  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 
226 aa  185  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 
244 aa  184  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 
239 aa  184  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 
229 aa  184  9e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 
243 aa  184  9e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 
243 aa  184  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1412  response regulator receiver protein  48.2 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  0.0125199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 
236 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 
237 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  43.1 
 
 
235 aa  183  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1752  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 
240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4712  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541483  normal  0.0134498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>