More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0223 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0223  response regulator receiver protein  100 
 
 		 315 aa  637    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3162  response regulator receiver protein  38.62 
 
 		 450 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2890  response regulator receiver protein  37.57 
 
 		 457 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0671992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1315  response regulator receiver protein  36.25 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2286  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 263 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000997036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1527  response regulator receiver protein  34.98 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.01 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1242  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.21 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03440  putative DNA-binding response regulator PhoB  32.67 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2464  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0791  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778943 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 1131 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2781  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  33.93 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  39.83 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0584  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  39.82 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.34 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 166 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1761  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  36.72 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4308  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.61 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.15 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  33.57 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  31.41 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.18 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2294  two component transcriptional regulator  33.93 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000876575  normal  0.575243 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  32.87 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  33.57 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32.14 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  34.96 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  33.57 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.04 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.04 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_002936  DET0232  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.156156  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  32.87 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.08 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  36.59 
 
 		 124 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05120  osmolarity response regulator  35.94 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0959  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.68 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.159493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.66 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2160  two component transcriptional regulator  32.94 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71041  hitchhiker  0.000000282055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.43 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  35.71 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0358  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.68 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1461  response regulator receiver  32.76 
 
 		 233 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000661728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  33.04 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  35.96 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  33.04 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  33.04 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  33.04 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  33.04 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  33.04 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  33.04 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  33.04 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  33.04 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.51 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  32.81 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2814  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  33.6 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  33.6 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  37.39 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1096 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  34.48 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>