More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3565 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  257  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  87.29 
 
 		 133 aa  221  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  87.29 
 
 		 124 aa  221  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  87.29 
 
 		 124 aa  221  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  82.11 
 
 		 125 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  61.34 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  60.66 
 
 		 123 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  58.68 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  55.17 
 
 		 125 aa  141  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 123 aa  131  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  45.97 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  45.97 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  43.59 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  40 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 397 aa  103  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1274 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 392 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 236 aa  98.6  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 225 aa  98.6  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1494  response regulator receiver protein  41.6 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2464  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 229 aa  97.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 1977 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 236 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 1245 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 236 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 234 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 233 aa  94.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 225 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 225 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 228 aa  94  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  44.04 
 
 		 651 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 134 aa  93.6  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4732  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.539442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 225 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  45.37 
 
 		 645 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 236 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 224 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  43.12 
 
 		 651 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 227 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 391 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 224 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 232 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4308  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.82 
 
 		 552 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  43.59 
 
 		 403 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 230 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  43.22 
 
 		 803 aa  91.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.51 
 
 		 235 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 685 aa  91.3  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  39.34 
 
 		 224 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  40.34 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 918 aa  90.5  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 225 aa  90.5  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 231 aa  90.9  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.34 
 
 		 224 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 230 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.52 
 
 		 237 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 235 aa  90.1  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 227 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 216 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 232 aa  90.1  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 234 aa  90.1  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 		 224 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 235 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  37.4 
 
 		 235 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.34 
 
 		 224 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  37.4 
 
 		 235 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  37.4 
 
 		 235 aa  89.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  37.4 
 
 		 235 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  39.67 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 391 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  37.4 
 
 		 235 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  37.4 
 
 		 235 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 233 aa  90.1  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  37.4 
 
 		 235 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  37.4 
 
 		 235 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  37.4 
 
 		 235 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  39.32 
 
 		 223 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.09 
 
 		 226 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>