More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3308 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  259  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  80.77 
 
 		 130 aa  218  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 123 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  52.89 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  44.8 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 123 aa  126  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  47.15 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  46.22 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  44.09 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  45.97 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  45.83 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 246 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 247 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  40.65 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 246 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 246 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 249 aa  97.1  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 257 aa  96.7  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 263 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 232 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 		 947 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 247 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 		 397 aa  94.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 272 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 392 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 229 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.21 
 
 		 589 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1271 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  38.79 
 
 		 260 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 260 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  38.79 
 
 		 260 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 229 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.03 
 
 		 454 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  38.79 
 
 		 260 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0522  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 124 aa  91.3  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  44.12 
 
 		 229 aa  91.3  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  41.67 
 
 		 229 aa  90.5  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 962 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  38.02 
 
 		 258 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  37.61 
 
 		 221 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  42.24 
 
 		 229 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.24 
 
 		 229 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 221 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  38.58 
 
 		 971 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 229 aa  88.6  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 227 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 242 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 579 aa  88.6  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  37.61 
 
 		 221 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0537  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 229 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 234 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 230 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 229 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 229 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  36.21 
 
 		 268 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 229 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 233 aa  87.8  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  37.8 
 
 		 969 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 229 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  38.79 
 
 		 228 aa  87.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  37.01 
 
 		 1060 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 234 aa  87.8  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  38.66 
 
 		 226 aa  87.8  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 		 1039 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  40.32 
 
 		 229 aa  87.4  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0584  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 250 aa  87.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.02 
 
 		 1053 aa  87  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 259 aa  87  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 255 aa  87  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 228 aa  87  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 265 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 229 aa  87  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.32 
 
 		 229 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  37.93 
 
 		 265 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2464  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 229 aa  86.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.82 
 
 		 201 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1274 aa  86.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 262 aa  86.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.82 
 
 		 201 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 229 aa  87  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>