More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4302 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  100 
 
 
124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  78.86 
 
 
128 aa  215  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  50.41 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  50.89 
 
 
124 aa  116  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
123 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  44.17 
 
 
121 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
130 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  44.17 
 
 
121 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
123 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  42.61 
 
 
123 aa  103  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  44.64 
 
 
134 aa  103  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
130 aa  102  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  40 
 
 
125 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
128 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
124 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
126 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  38.52 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.73 
 
 
1160 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  38.66 
 
 
124 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
124 aa  94  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
392 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  40 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
1002 aa  93.2  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 
699 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
133 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 
633 aa  92  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  37.5 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  37.5 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
1578 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  39.02 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
1611 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
397 aa  90.5  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
865 aa  90.5  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
1099 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0067  histidine kinase  39.32 
 
 
486 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  37.82 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
301 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  39.34 
 
 
1026 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
922 aa  88.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
939 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  42.02 
 
 
132 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  37.93 
 
 
810 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
564 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.21 
 
 
1499 aa  88.2  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
1245 aa  87.8  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  36.13 
 
 
2301 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  38.33 
 
 
355 aa  87.8  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
1090 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
1090 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
1058 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
126 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3150  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  36.13 
 
 
2284 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
833 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
887 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 
929 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
612 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
394 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
1240 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
376 aa  86.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  38.46 
 
 
2051 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1030  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.82 
 
 
330 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
981 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
687 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  37.61 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
230 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.87 
 
 
720 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.425295  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
1788 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2619  histidine kinase  39.82 
 
 
667 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.01076  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2670  histidine kinase  39.82 
 
 
667 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.754609  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
678 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  37.19 
 
 
961 aa  84.7  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3589  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.517802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
844 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0962  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 
377 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115091  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
309 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
1977 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2175  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
395 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924768  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
844 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 
331 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
1131 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
123 aa  84.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
123 aa  84.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  36.8 
 
 
800 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.5 
 
 
385 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50640  response regulator with metal dependent phosphohydrolase activity (two-component)  43.7 
 
 
347 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
1310 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2336  response regulator receiver protein  36.51 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103968  normal  0.760096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>